BCH725 - Analyse de données génomiques avec R

Cible(s) de formation

Utiliser l’environnement de R pour l’analyse et la visualisation de données biologiques. Utiliser les connaissances acquises en R pour l’analyse de données de RNA-seq. Comprendre et utiliser les objets et les fonctions de base de l’environnement R. Importer des données biologiques dans R, et utiliser et explorer cet environnement et la panoplie de fonctions disponibles pour analyser et visualiser ces données. Comprendre et appliquer les étapes d’analyse d’une expérience de séquençage d’ARN à haut-débit à l'aide de R, incluant la lecture du contrôle de la qualité du séquençage jusqu’à l’analyse d'expression différentielle.

Contenu

Environnement de R pour analyse et visualisation de données biologiques. Analyse de données de RNA-seq. Données biologiques dans R, fonctions disponibles pour analyse et visualisation de ces données. Étapes d’analyse d’une expérience de séquençage d’ARN à haut-débit à l'aide de R, lecture du contrôle de la qualité du séquençage, analyse d'expression différentielle.