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2026 - École de pointe en Analyse des pistes en écologie

Formation en ligne asynchrone

Disponible à compter du 25 janvier 2026

Description de l'activité pédagogique

ECL 805 Analyse des pistes en écologie II (3 crédits)

Cette activité pédagogique s'adresse aux personnes étudiantes à la maîtrise ainsi qu'au doctorat.

Les écologistes posent souvent des hypothèses de cause à effet impliquant plusieurs variables dans des systèmes pour lesquels des expériences randomisées et contrôlées ne sont pas possibles. Lorsque cela se produit, il faut utiliser un ensemble de méthodes statistiques appelées « modélisation d'équations structurelles » ou « analyse des pistes ».

Ce cours sur la modélisation par équations structurelles et l’inférence causale est basé sur l’ouvrage de l’enseignant Bill Shipley, Cause and Correlation in Ecology: A User’s Guide to Path Analysis, Structural Equations and Causal Inference in R (Cambridge University Press, 2e édition). Les personnes inscrites doivent se procurer cet ouvrage, disponible notamment auprès de Cambridge University Press ou d’Amazon.

Entièrement offerte en ligne, l'activité pédagogique comprend plus de 18 heures de cours magistraux, incluant des séances pratiques de réalisation des analyses avec le logiciel R. Les contenus sont présentés sous forme de vidéos, accompagnées de l’ensemble des fichiers RStudio utilisés dans le cadre de la formation.

Les personnes inscrites bénéficieront d’un accès aux vidéos pour une durée d’une session complète (4 mois). Il est donc possible de suivre ce cours au moment qui vous convient le mieux.

Modalités d’évaluation

  • Un examen à livre ouvert (open-book) sera fourni par l’enseignant après avoir complété la formation
  • Cette formation est offerte en anglais; toutefois, les questions en français sont les bienvenues

  1. Vous devez avoir une connaissance de base en analyse statistique (tests inférentiels, corrélation, régression et modèles linéaires)
  2. Vous devez avoir une connaissance de base du logiciel statistique R
  3. Vous devez disposer d'un ordinateur avec R installé incluant les bibliothèques suivantes : lavaan, ggm, piecewiseSEM, CausalToolbox (disponible sur Github) et pwSEM (disponible sur Github à l'adresse https://github.com/BillShipley/pwSEM)
  4. Vous devez posséder une adresse courriel Gmail afin d’obtenir l’accès aux vidéos du cours

(incluant des séances pratiques pour chacun)

  • Méthodes expérimentales, contrôle des variables et leur relation avec SEM
  • Concept de séparation-d et logique du test dsep
  • Extensions des modèles dsep à des types de données plus complexes : glm, modèles mixtes, corrections phylogénétiques; la bibliothèque PiecewiseSEM
  • Algèbre de covariance; Équations structurelles; Paramètres libres/fixes; ML chi carré; la logique du SEM
  • Package lavaan en R pour SEM; effets de décomposition
  • Notion de variables latentes; modèles de mesure; montage avec lavaan
  • Types de variables latentes et leur importance pour l'écologie
  • Modèle SEM complet; méthodes robustes; Chi carré de Monte Carlo; indices d'ajustement approximatifs
  • Modèles multigroupes; corrections phylogénétiques
  • Méthodes exploratoires

Coût

  • Les frais d’inscription sont assumés par le Département de biologie et la Faculté des sciences

Admission et inscription

1.  Document(s) requis pour votre admission

  • Aucun document requis

  • Copie du certificat de naissance

  • Copie du certificat de naissance

  • Copie recto verso de la carte de citoyenneté OU copie recto verso de la carte de résident permanent et copie du passeport
  • Copie du certificat de naissance

  • Copie du passeport

2.  Formulaire d'admission

* Sections à remplir :
  • Pour les personnes étudiant au Québec ou ayant étudié au Québec : Compléter les sections 1 à 8 du formulaire
  • Pour toutes les autres personnes : Compléter les sections 1 à 5 ainsi que 7 et 8 du formulaire

3.  Transmission du formulaire et des documents requis

  • Par courriel à l'adresse etud.superieures.biologie@USherbrooke.ca
  • À la suite de la confirmation de l’inscription, un courriel de Bill Shipley sera transmis aux personnes inscrites. Celui-ci contiendra l’ensemble des informations et instructions nécessaires pour accéder à la plateforme de formation.

Obtention des crédits universitaires

  • Personnes étudiantes inscrites dans un programme en biologie à l'Université de Sherbrooke : Cette activité pédagogique fait partie de l'offre de cours du programme de maîtrise de type recherche et de doctorat en biologie du Département de biologie de l'Université de Sherbrooke. Ainsi, les crédits associés à ce cours pourront donc être intégrés au programme de maîtrise ou de doctorat, sous réserve du respect des exigences de la formation.
  • Personnes étudiantes inscrites dans une autre université québécoise ou à l’extérieur du Québec : Vérifier auprès de leur établissement d’origine si ces crédits peuvent être reconnus et, le cas échéant, les modalités de transfert.

Relevé de notes

Pour obtenir un relevé de notes officiel, vous devez effectuer la demande via le formulaire en ligne sur la plateforme Web sécurisée de l'UdeS. À noter que vous êtes responsable d’organiser le transfert des crédits.

Date limite
Cette formation est disponible en tout temps à compter du 25 janvier 2026.

Nous joindre

Courriel : etud.superieures.biologie@USherbrooke.ca