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2024 - École d'été en Analyse des pistes en écologie

Du 2 au 7 juin 2024

Description du cours

ECL 805* Analyse des pistes en écologie II

Ce cours s'adresse aux personnes étudiantes à la maîtrise ainsi qu'au doctorat.

* Veuillez noter qu'il s'agit du sigle de cours que vous devrez saisir lors de votre inscription.

Les écologistes posent souvent des hypothèses de cause à effet impliquant plusieurs variables dans des systèmes pour lesquels des expériences randomisées et contrôlées ne sont pas possibles. Lorsque cela se produit, il faut utiliser un ensemble de méthodes statistiques appelées « modélisation d'équations structurelles » ou « analyse des pistes ». Pendant ce cours intensif de cinq jours, vous apprendrez les bases de ces méthodes et comment les appliquer dans vos recherches écologiques. Les séances théoriques seront entrecoupées de séances pratiques utilisant le logiciel gratuit R. Nous vous encourageons à utiliser vos propres ensembles de données autant que possible.

Ce cours est répertorié comme un cours de niveau doctorat, mais les personnes étudiantes à la maîtrise ainsi que les personnes stagiaires postdoctorales peuvent également le suivre. Nous pouvons accueillir un maximum de 30 personnes et la priorité sera donnée aux étudiantes et étudiants. La journée de cours débutera à 9 h et se terminera à 17 h chaque jour à l'exemption de la dernière journée qui se terminera à midi.

Réservation

Contenu

Le contenu du cours suit Shipley, B. 2016. Cause and Correlation in Ecology : A user’s guide to path analysis, structural equations and causal inference in R, Cambridge University Press (2e édition). Vous devez en avoir une copie. Il est possible de la commander auprès de Cambridge University Press ou d'Amazon.

Cette école d'été s'adresse à un public international, la langue d'enseignement est l'anglais, mais les questions en français sont les bienvenues.

  1. La priorité est donnée aux personnes étudiantes diplômées (MSc, PhD) ainsi qu'aux personnes stagiaires postdoctorales et le nombre maximal de places est de 30. Les personnes autres que les étudiantes et étudiants diplômés peuvent suivre le cours si des places restantes sont disponibles.
  2. Vous devez avoir une connaissance de base en analyse statistique (tests inférentiels, corrélation, régression et modèles linéaires)
  3. Vous devez avoir une connaissance de base du logiciel statistique R
  4. Vous devez disposer d'un ordinateur portable avec R installé avant le début du cours, incluant les bibliothèques suivantes : lavaan, ggm, piecewiseSEM et CausalToolbox (cette dernière est disponible sur Github)

(incluant des séances pratiques pour chacun)

  • Méthodes expérimentales, contrôle des variables et leur relation avec SEM
  • Le concept de séparation-d et la logique du test dsep
  • Extensions des modèles dsep à des types de données plus complexes : glm, modèles mixtes, corrections phylogénétiques; la bibliothèque PiecewiseSEM
  • Algèbre de covariance; Équations structurelles; Paramètres libres/fixes; ML chi carré; la logique du SEM
  • Le package lavaan en R pour SEM; effets de décomposition
  • La notion de variables latentes; modèles de mesure; montage avec lavaan
  • Types de variables latentes et leur importance pour l'écologie
  • Le modèle SEM complet; méthodes robustes; Chi carré de Monte Carlo; indices d'ajustement approximatifs
  • Modèles multigroupes; corrections phylogénétiques
  • Méthodes exploratoires

    Cours en ligne

    Le contenu de ce cours est également disponible sous forme de cours en ligne pour les particuliers, disponible à tout moment, à cette adresse : https://billshipley45.wixsite.com/onlinesem

    À noter que la version en ligne n'est pas associée à l'Université de Sherbrooke et qu'elle ne vous permet pas d'obtenir de crédit universitaire.

    Coût

    • Personnes étudiantes inscrites dans un programme en biologie à l'Université de Sherbrooke
      Le cours fait partie du programme de maîtrise et de doctorat en biologie. Il peut être inscrit directement dans votre programme sans coût supplémentaire. Les crédits associés à ce cours seront automatiquement attribués, si vous complétez les exigences de l’école d’été.
    • Personnes étudiantes inscrites dans une autre université québécoise
      Vous devez vous inscrire via la plateforme du Bureau de coopération interuniversitaire (BCI). Le cours sera inscrit dans votre dossier étudiant et les frais, le cas échéant, seront facturés par votre université. Les crédits associés à ce cours seront automatiquement attribués, si vous complétez les exigences de l’école d’été.
    • Autres personnes étudiantes ou personnes désirant participer à l’école d’été
      Les frais d’inscription sont assumés par le Département de biologie et la Faculté des sciences.

    Réservation de chambre sur le campus

    Un maximum de 15 chambres aux résidences est disponible pour la location pendant la durée du cours.

    Obtention des crédits universitaires

    Ce cours fait partie de l'offre de cours du Département de biologie de l'Université de Sherbrooke.

    Les personnes étudiantes inscrites dans une autre université québécoise doivent s'inscrire via la plateforme du Bureau de coopération interuniversitaire (BCI). L’activité pourra être reconnue dans leur programme d’études par l’université d’origine.

    Les personnes étudiantes des universités hors Québec doivent se renseigner auprès de leur établissement d'origine si ces crédits peuvent être reconnus et, le cas échéant, comment organiser le transfert.

    Relevé de notes

    Pour obtenir un relevé de notes officiel, vous devez effectuer la demande via le formulaire en ligne sur la plateforme Web sécurisée de l'UdeS. À noter que vous êtes responsable d’organiser le transfert des crédits.

    Informations nécessaires avant votre inscription

    • Nom de famille
    • Prénom
    • Citoyenneté
    • Ville et pays de naissance
    • Nom de jeune fille de la mère
    • Nom du père
    • Adresse postale
    • Adresse courriel

    • Citoyen canadien et résident du Québec : numéro de code permanent et une copie de votre acte de naissance
    • Citoyen canadien d'une autre province : copie de votre acte de naissance
    • Résident permanent : copie recto verso de votre carte de résident permanent et une copie de votre acte de naissance
    • Résident permanent devenu citoyen canadien : copie recto verso de votre carte de citoyenneté et une copie de votre acte de naissance
    • Citoyen étranger : une copie de votre passeport, du CAQ et de votre permis d'études

    • Citoyen canadien : une copie de votre acte de naissance
    • Résident permanent du Canada : une copie recto verso de votre carte de résident permanent, une copie de votre acte de naissance et une copie de votre : CSQ (certificat de sélection du Québec), le cas échéant
    • Résident permanent devenu citoyen canadien : une copie recto verso de votre carte de citoyenneté et une copie de votre acte de naissance
    • Citoyen étranger : une copie de votre passeport

    Date limite
    La date limite d'inscription, y compris la réception de tous les documents nécessaires, est le 15 avril.

    Documents et fonctions R à obtenir avant le cours

    Nous ferons parvenir à chaque étudiante et étudiant un ensemble de fichiers zippés contenant les documents, les présentations PowerPoint et les fichiers R Studio environ deux semaines avant le début du cours. Informez-nous si vous ne les recevez pas.

    Nous joindre

    Courriel : Bill.Shipley@USherbrooke.ca