OMX703 - Approches métagénomiques

Cible(s) de formation

Se familiariser avec les différentes approches de séquençage métagénomique courantes et modernes, utilisées en biologie moléculaire. Comprendre et être capable d'analyser bio-informatiquement les résultats découlant de différentes approches en plus d’identifier leurs forces et faiblesses. 

Contenu

Présentation des approches de séquençage métagénomique de marqueurs courts (p. ex. 16S) ou de type « shotgun ». Conception d’amorces, analyse critique des forces et faiblesses des approches et application des méthodes à des échantillons mixtes, analyses bio-informatiques et interprétation des résultats pour identifier les abondances relatives.