OMX701 - Méthodes transcriptomiques

Cible(s) de formation

Se familiariser avec les méthodes de séquençage des molécules d’ARN. Réaliser des protocoles de préparation et de séquençage d’échantillon d’ARN. Interpréter des résultats bruts et effectuer des analyses bio-informatiques pertinentes. Comprendre les forces et les faiblesses de différentes approches méthodologiques.

Contenu

Présentation des approches de séquençage du transcriptome, aspects importants et contrôle de qualité de la préparation des échantillons (déplétion ARN ribosomaux vs enrichissement ARNm), application des méthodes au séquençage de cellules procaryotes et eucaryotes dans des conditions de croissance différentes, analyses bio-informatiques et interprétation des résultats pour identifier les gènes différentiellement exprimés.