Plateforme d'instrumentalisation de biologie
La plateforme d’instrumentation du Département de biologie de l’Université de Sherbrooke met à la disposition de la communauté scientifique des équipements spécialisés et une expertise de pointe, afin de soutenir la réalisation de projets de recherche ambitieux. Elle favorise la collaboration, l’innovation et l’avancement des connaissances en offrant un accès simplifié à des ressources technologiques de haut niveau.
Accessible tant aux équipes de l’Université de Sherbrooke qu’aux partenaires externes issus des milieux académiques, gouvernemental et privé.
Services offerts
Microscopie
Accédez à des microscopes performants pour l’imagerie d’une grande variété d’échantillons. Bénéficiez d’un accompagnement complet, de la planification des expériences à l’analyse des images, ainsi que d’une formation adaptée favorisant une prise en main rapide et autonome des équipements.
Olympus FV3000
Le microscope confocal Olympus FV3000 permet l’acquisition d’images en fluorescence de haute résolution, en deux ou trois dimensions, grâce à la microscopie confocale à balayage laser. Adapté à une grande diversité d’échantillons, des cellules vivantes aux tissus fixés, il est équipé d’un système d’incubation permettant l’imagerie en conditions physiologiques contrôlées. Sa puissance laser avancée offre également la possibilité d’induire des dommages à l’ADN, facilitant l’étude des mécanismes de réparation.
Caractéristiques techniques
- Doté de 5 lasers (405, 445, 488, 561 et 647 nm)
- Technologie de détection spectrale permettant de maximiser la variété de fluorophores pouvant être observés
- Muni de quatre détecteurs, dont deux à haute sensibilité, afin de permettre l’acquisition de faibles signaux
- Système d’incubation permettant le contrôle de la température et du niveau de CO2
- Système d’autofocus
- Objectifs de 4 à 60X
Zeiss Axio Observer Z1
Microscope inversé entièrement automatisé, idéal pour l’acquisition d’images en fluorescence ou en lumière transmise, sur lames ou en plaques multi-puits. Il permet des acquisitions complexes (multi-canaux, Z-stack, multi-positions et en time-lapse) de façon entièrement automatisée.
Grâce à sa chambre environnementale, il est possible d’imager des cellules vivantes dans des conditions de croissance contrôlées. Ses objectifs à grande ouverture numérique et sa caméra haute résolution assurent une qualité d’image optimale, tandis que l’option Apotome permet d’obtenir des sections optiques avec une meilleure résolution axiale.
Caractéristiques techniques
- Acquisition en lumière transmise : champ clair, contraste de phase et contraste interférentiel (selon les objectifs)
- Acquisition en épifluorescence : DAPI, CFP, GFP, YFP, Cy3, Cy5
- Incubateur à température contrôlée
- Caméra couleur (Zeiss Axiocam 105) et monochrome (Zeiss Axiocam 506)
- Objectifs de 5 à 100X
- Système d’autofocus
Zeiss Axio Imager M1
Microscope droit polyvalent permettant l’acquisition d’images en champ clair, en contraste de phase et en épifluorescence (DAPI, GFP, RFP). Il offre également la possibilité de réaliser des Z-stacks afin d’observer les structures à différentes profondeurs et d’obtenir une visualisation plus complète des échantillons.
Caractéristiques techniques
- Acquisition en lumière transmise : champ clair et contraste de phase
- Acquisition en épifluorescence : DAPI, GFP, RFP
- Caméra couleur (Zeiss Axiocam MRC)
- Objectifs de 5 à 100X
Sartorius Incucyte S3
Le système Incucyte S3 permet l’imagerie et l’analyse automatisées de cellules vivantes directement dans l’incubateur, sans perturber les conditions de culture. Il capture des images en temps réel, en contraste de phase ou en fluorescence, sur de longues périodes. Idéal pour suivre la croissance, la morphologie, la migration et les réponses cellulaires, il offre un suivi continu et quantitatif des expériences en conditions physiologiques stables.
Caractéristiques techniques
- Acquisition d’images en contraste de phase et en fluorescence (GFP, RFP)
- Objectifs 4X, 10X, 20X
- Accepte les plaques 6, 12, 24, 48, 96 et 384 puits
- Jusqu’à 6 plaques peuvent être placées sur l’appareil simultanément
Leica M165FC
Stéréomicroscope avec zoom jusqu’à 16,5×, idéal pour l’entomologie, la dissection et l’analyse de matériaux. Il offre une grande flexibilité d’éclairage grâce à une base en lumière transmise (champ clair et champ sombre) et à des bras latéraux ajustables, permettant d’adapter l’observation à une grande variété d’échantillons.
Équipé pour l’épifluorescence, il comprend une caméra couleur et une caméra monochrome, assurant une acquisition d’images de qualité. Son système encodé permet également d’obtenir des images calibrées, facilitant la réalisation de mesures précises.
Caractéristiques techniques
- Zoom de 16,5X
- Objectif de 0.63X
- Illumination transmise en champ clair, champ sombre ou en contraste de relief
- Illumination latérale avec bras flexibles
- Illumination pour la fluorescence (DAPI, CFP, GFP, YFP, RFP)
- Caméras couleur (Leica M170HD) et monochrome (Leica DFC3000G)
Traitement et analyse d'images
La plateforme d’instrumentation en biologie offre un accompagnement spécialisé pour le traitement et l’analyse d’images, afin d’en extraire rapidement des données fiables et quantitatives. À l’aide de logiciels reconnus (ImageJ/Fiji, CellProfiler, QuPath, Ilastik, Python), les analyses peuvent être réalisées de manière manuelle, automatisée ou semi-automatisée, selon les besoins.
De l’amélioration d’image à la segmentation et à la quantification, en passant par le stitching et la correction du bruit, une large gamme de traitements est disponible, applicable à divers types d’échantillons. Au besoin, des scripts personnalisés peuvent être développés pour automatiser les analyses, améliorer la reproductibilité et optimiser le temps de traitement.
Cytométrie
Accédez à des cytomètres analyseurs performants pour vos besoins en cytométrie, avec formation à l’appui pour une utilisation autonome. La plateforme offre également un service de tri cellulaire permettant d’isoler précisément des sous-populations selon leurs caractéristiques en fluorescence.
Cytek Aurora
Le Cytek Aurora est un cytomètre en flux de nouvelle génération basé sur la détection spectrale, permettant l’analyse simultanée d’un grand nombre de marqueurs fluorescents par cellule. Équipé de quatre lasers (405, 488, 561 et 640 nm), il offre la détection de plus de 40 paramètres et une grande flexibilité dans la conception de panels complexes.
Sa technologie d’analyse spectrale permet de réduire le bruit de fond et de distinguer des signaux très proches, améliorant ainsi la sensibilité et la précision des mesures. Doté d’un chargeur de plaques, il facilite également l’acquisition automatisée d’échantillons en formats multi-puits.
Idéal pour les études multiparamétriques, il se démarque particulièrement pour les échantillons présentant une forte autofluorescence ou pour l’utilisation de fluorophores difficiles à discriminer.
Caractéristiques techniques
- Quatre lasers (405, 488, 561, 640 nm)
- Système de détection spectral de plus de 40 détecteurs
- Possibilité d’utilisation en mode spectral ou en mode conventionnel
- Acquisition en tubes ou en plaque 96 puits
BD Accuri C6 plus
Le BD Accuri C6 Plus est un cytomètre en flux simple d’utilisation, conçu pour l’analyse rapide et fiable de populations cellulaires. Équipé de deux lasers (488 et 640 nm), il permet la détection de six paramètres, dont quatre marqueurs fluorescents.
Doté d’un chargeur de plaques, il facilite l’acquisition automatisée en tubes ou en formats multi-puits. Son interface intuitive en fait un outil idéal pour les analyses de routine nécessitant des données reproductibles et de qualité.
Caractéristiques techniques
- Deux lasers (488 et 640 nm)
- Détection de 6 paramètres dont 4 pour la fluorescence
- Acquisition automatisée avec portoir de 24 tubes ou pour les plaques multi-puits (48 et 96 puits)
BD FACSJazz
Le BD FACSJazz est un trieur de cellules compact permettant d’isoler des populations cellulaires ou de déposer des cellules uniques selon leurs propriétés de fluorescence. Équipé de deux lasers, il permet la détection de six paramètres, dont quatre en fluorescence.
Fiable et performant, il assure un tri avec une bonne pureté et une viabilité élevée, que ce soit pour des cellules transfectées, marquées ou issues de populations hétérogènes.
Caractéristiques techniques
- Lasers 488 nm et 561 nm
- Détection de 6 paramètres dont 4 pour la fluorescence
- Tri en tube 5ml ou 15 ml ainsi qu’en plaque 96 puits
- Deux voies de tri
- Possibilité de dépôt de cellules uniques
Lecteurs de plaques multimodes
Accédez à des lecteurs de plaques multimodes Biotek Synergy H1 permettant de réaliser une vaste gamme de mesures en absorbance, fluorescence et luminescence sur des échantillons en plaques multi-puits. Adaptés à de nombreux essais biologiques et biochimiques, ils offrent également des fonctions d’incubation et d’agitation, idéales pour les expériences en cinétique et le contrôle des conditions environnementales.
Compatibles avec une grande variété de formats (de 6 à 384 puits), ces appareils intègrent aussi un module Take3 pour la mesure de microvolumes, facilitant le dosage rapide d’acides nucléiques et de protéines lorsque les quantités d’échantillons sont limitées.
Analyse et préparation d’acides nucléiques
L’Agilent Fragment Analyzer 5200 est un système automatisé d’analyse de fragments d’acides nucléiques permettant d’évaluer avec précision l’intégrité, la taille et la concentration de l’ADN et de l’ARN. Basé sur une technologie d’électrophorèse capillaire hautement sensible, il offre une résolution supérieure aux gels traditionnels et une excellente reproductibilité, tout en réduisant les manipulations manuelles.
Polyvalent, il permet l’analyse d’une large gamme d’échantillons, des fragments courts aux acides nucléiques de grande taille, et génère rapidement des résultats quantitatifs et qualitatifs sous forme de profils détaillés. Il constitue un outil de choix pour le contrôle de qualité en génomique, notamment en préparation d’échantillons et avant le séquençage.
La plateforme met à la disposition des utilisateurs plusieurs appareils de qPCR permettant la quantification précise d’acides nucléiques pour une grande variété d’applications, notamment l’expression génique, la détection d’agents pathogènes, l’analyse de variations génétiques et la validation de librairies.
La présence de plusieurs instruments assure une grande disponibilité et permet de répondre efficacement à des besoins variés, qu’il s’agisse d’analyses ponctuelles ou de projets à plus haut volume.
Le Covaris ME220 est un système de fragmentation acoustique permettant de préparer des échantillons d’ADN ou d’ARN avec une grande précision et une excellente reproductibilité. Grâce à la technologie AFA (Adaptive Focused Acoustics), il génère des fragments de taille contrôlée sans échauffement significatif, préservant ainsi l’intégrité des acides nucléiques.
Son procédé automatisé et en système fermé réduit les risques de contamination et assure une préparation homogène des échantillons, essentielle pour les applications de séquençage de nouvelle génération (NGS). Facile d’utilisation, il offre un contrôle optimal des paramètres pour garantir une qualité constante d’un échantillon à l’autre.
Contact
Pour toute question ou pour obtenir les grilles tarifaires, communiquez avec Daniel Garneau, responsable de la plateforme d’instrumentation de biologie.