Présentation

Sujets de recherche

Digestive System, Stem Cells and Organogenesis, Embryonic Development, Cancer of the Digestive System, Crohn's Disease, Gastrointestinal Pathologies.

Disciplines de recherche

Cell Biology, Molecular Biology.

Mots-clés

Cancer, Cell interactions, Epithelium, Extracellular matrix, Gene expression, Inflammatory bowel diseas, Integrins, Intestine, Stem cells, Transcription factors.

Centre de recherche

Centre de recherche du CHUS

Langues parlées et écrites

Anglais, Français

Prix et distinctions

• (2022) CIHR Peer Review Committee Member for various Committees (HDK, POP, CP and CBC). Canadian Institutes for Health Research.
• (2020) Co-Chair for the Microscopical Society of Canada 2020 Conference. Microscopical Society of Canada.
• (2019) Section Editor for BMC Molecular Biology. BMC Journals. (Honor).
• (2011) CCTC AWARD of Excellence 2011 from the Canadian Connective Tissue Conference. Canadian Connective Tissue Conference. (Prize / Award).
• (2010) Prix Étienne-Le Bel 2010 à la FMSS - Senior Investigator of the Year. Université de Sherbrooke. (Prize / Award).
• (2005) Président du Club de recherches cliniques du Québec. Club de recherche clinique du Québec. (Honor).
• American Gastroenterological Association Fellow (AGAF). American Gastroenterological Association. (Distinction).
• Canada Research Chair in Intestinal Physiopathology Not renewed as per the U de S rules for maximal allowed holding period. Chaire de recherche du Canada. (Distinction).
• Editor for the book: Colorectal cancer, Methods and Protocols. Springer's Protocols Methods in Molecular Biology. (Honor).
• Guest Editor for the special issue "Colorectal Cancer" in the journal "Cancers". MDPI Journals. (Honor).

Financement

Grant. (Awarded). Principal Applicant. Effects of human milk exosomal microRNAs on intestinal cells. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Project Scheme. 620000 $ (2019-2023).

Grant. (Awarded). Principal Applicant. Cell-matrisome interactions as a key component of the intestinal stem cell niche. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC). Discovery Grant Program. 200000 $ (2017-2022).

Grant. (Awarded). Principal Applicant. The 2020 Annual Meeting of the Microscopical Society of Canada/Société de microscopie du Canada. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Planning and Dissemination Grant. 10000 $ (2020).

Grant. (Awarded). Principal Applicant. Development of a mass spectrometry-based stool test for improving the diagnosis and management of inflammatory bowel disease. Crohn's & Colitis Foundation of Canada (CCFC). Innovation Grants. 50000 $ (2019-2020).

(Awarded). Principal Applicant. Exploration du potentiel de l'analyse des selles en spectrométrie de masse pour la mise au point d'un test non invasif de prédiction de l'enterocolite nécrosante chez le nouveau né prématuré. Fondation des étoiles (La) (Qc). Sherbrooke Division. 11600 $ (2019-2020).

Grant. (Awarded). Co-investigator. Les probiotiques maternels en fin de grossesse : vers un nouveau mode de prévention de l’entérocolite nécrosante du nouveau-né (ENN). Fondation des étoiles (La) (Qc). Concours interne. 14995 $ (2018-2020).

Grant. (Completed). Principal Applicant. Procedure for optimization for preparing human fecal samples for mass spectrometry analysis. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC). Engage grants for universities. 25000 $ (2019).

Contract. (Completed). Principal Investigator. Validation of a Multitarget Stool mRNA test for colorectal cancer detection. Aligo Innovation. PSVT. 35000 $ (2018-2019).

Contract. (Completed). Principal Investigator. Development of a mass spectrometry-based screening test for the early detection of colorectal cancers. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Projets structurants 2017. 75000 $ (2017-2018).

Grant. (Completed). Principal Applicant. Multitarget Stool mRNA test for colorectal cancer detection. Initial investment. Initial investment. 9932 $ (2017-2018).

Grant. (Completed). Principal Investigator. Stemness and cellular hierarchy in the human intestinal crypt. (2012-2017).

Grant. (Completed). Principal Applicant. Cell-Matrisome interactions as a key component of the intestinal stem cell niche. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC). Discovery. 31000 $ (2016-2017).

Research Chair. (Completed). Principal Investigator. Chaire de recherche du Canada en physiopathologie intestinale. (2001-2016).

Grant. (Completed). Principal Investigator. Dépistage du cancer colorectal: amelioration du test immunochimique de recherché du sang occulte dans les selles par la detection de nouveaux biomarqueurs.. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Projets structurants. 80000 $ (2015-2016).

Publications

Articles de revue

• Beaulieu JF. (2020). Colorectal Cancer Research: Basic, Preclinical, and Clinical Approaches. Cancers, 12(2), E416. (Published).
• Gagné D, Benoit YD, Groulx JF, Vachon PH, Beaulieu JF. (2020). ILK supports RhoA/ROCK-mediatedcontractility of human intestinal epithelial crypt cells by inducing thefibrillogenesis of endogenous soluble fibronectin during the spreading process. BMC Mol Cell Biol, in press, 1-19. (In Press).
• Beaulieu JF, Herring E. (2020). Toward a stool mRNA-based assay for detection colorectal cancerous lesions. Gastreoenterology, 158, 793. DOI. (Published).
• Thibault MP, Tremblay E, Wallace JL, Beaulieu JF. (2019). Effect of ketoprofen and ATB-352 on the immaturehuman intestine: identification of responders and non-responders. J Ped Gastroenterol Nutri, 68, 623-629. (Published).
• Beaulieu JF. (2019). Integrin α6β4 in Colorectal Cancer: Expression, Regulation, Functional Alterations and Use as a Biomarker. Cancers, 12(41), 1-13. (Published).
• Cloutier G, Sallenbach-Morrissette A, Beaulieu JF. (2019). Non-integrin laminin receptors. Tissue Cell, 56, 71-78. (Published).
• Rispal J, Baron L, Beaulieu JF, Chevillard-Briet M, Trouche D, Escaffit F. (2019). The H2A.Z histone variant integrates Wnt signaling in intestinal epithelial homeostasis. Nat Commun, 10, 1827. (Published).
• Herring E, Kanaoka S, Tremblay E, Beaulieu JF. (2018). A Stool Multitarget mRNA Assay for the Detection of Colorectal Neoplasms. Methods Mol Biol, 1765, 217-227. DOI. (Published).
• Yeganeh PR, Leahy J, Spahis S, Patey N, Desjardins Y, Roy D, Delvin E, Garofalo C, Leduc-Gaudet JP, St-Pierre D, Beaulieu JF, Marette A, Gouspillou G, Levy E. (2018). Apple peel polyphenols reduce mitochondrial dysfunction in mice with DSS-induced ulcerative colitis. J Nutr Biochem, 57, 57-66. (Published).
• Gouspillou G, Leahy J, St-Pierre DH, Marette A, Beaulieu JF, Desjardins Y, Roy D, Yeganeh PR, Garofalo C, Leduc-Gaudet JP, Patey N, Delvin E, Levy E. (2018). Apple peel polyphenols reduce mitochondrial dysfunction in mice withdss-induced ulcerative colitis. J Nutritional Biochem, 57, 56-66. (Published).
• Boudjadi S, Carrier JC, Beaulieu JF. (2018). Identification of Response Elements on Promoters Using Site-Directed Mutagenesis and Chromatin Immunoprecipitation. Methods Mol Biol, 1765, 43-56. DOI. (Published).
• Ferretti E, Tremblay E, Thibault MP, Fallah S, Grynspan D, Burghardt K, Bettolli M, Babakissa C, Bertelle V, Levy E, Beaulieu JF. (2018). Impaired antimicrobial response and mucosal protection induced by ibuprofen in the immature human intestine. Pediatric Res, 84, 813-820. (Published).
• Beaulieu JF. (2018). Integrin alpha 6 variants in colorectal cancer. Gut, 67, 1747-1748. (Published).
• Groulx JF, Boudjadi S, Beaulieu JF. (2018). MYC Regulates ?6 Integrin Subunit Expression and Splicing Under Its Pro-Proliferative ITGA6A Form in Colorectal Cancer Cells. Cancers (Basel), 10, E42. (Published).
• Herring E, Kanaoka S, Tremblay É, Beaulieu JF. (2017). ITGA6Droplet digital PCR for quantification of in a stool mRNA assay for the detection of colorectal cancers. World J Gastroenterol, 23(16), 2891-2898. (Published).
• Boudjadi S, Beaulieu JF. (2017). In silico Analysis and Site-directed Mutagenesis ofPromoters. Bio-Protocol, 7, e2181. (Published).
• Boudjadi S, Bernatchez G, Sénicourt B, Beauséjour M, Vachon PH, Carrier JC, Beaulieu JF. (2017). Involvement of the integrin alpa1 beta1 in the progression of colorectal cancer. Cancers, 9, 96. (Published).
• Lepage M, Seltana A, Thibault MP, Tremblay É, Beaulieu JF. (2017). Knockdown of laminin alpha 5 stimulates intestinal cell differentiation. Biochem Biophys Res Commun, 495, 1510-1515. (Published).
• JF Groulx, S Boudjadi JF Beaulieu. (2017). MYC regulates alpha6 integrin subunit expression and splicing under its proproliferative ITGA6A form in colorectal cancer cells. Oncogene, -, -. (Submitted).
• Ferretti E, Tremblay E, Thibault MP, Grynspan D, Burghardt KM, Bettolli M, Babakissa C, Levy E, Beaulieu JF. (2017). The nitric oxide synthase 2 pathway is targeted by both pro- and anti-inflammatory treatments in the immature human intestine. Nitric Oxide, 66, 53-61. (Published).
• Marie Claude Denis, Denis Roy, Pantea Rahmani Yeganeh, Yves Desjardins, Thibault Varin, Nour Haddad, Devendra Amre, Alain Théophile Sané, Carole Garofalo, Alexandra Furtos, Natalie Patey, Edgard Delvin, Eric Tremblay, Andre Marette, Jean François Beaulieu, Emile Levy. (2016). Apple peel polyphenols: A key player in the prevention and treatment of experimental inflammatory bowel disease. Clinical Sciences (London), 130, 2217-2237. DOI. (Published).
• Ferron PJ, Dumazeau K, Beaulieu JF, Le Hégarat L, Fessard V. (2016). Combined Effects of Lipophilic Phycotoxins (Okadaic Acid, Azapsiracid-1 and Yessotoxin) on Human Intestinal Cells Models. Toxins (Basel), 8(2), 50. (Published).
• Roostaee A, Benoit YD, Boudjadi S, Beaulieu JF. (2016). Epigenetics in Intestinal Epithelial Cell Renewal. J Cell Physiol., 2016, 2361-2367. DOI. (Published).
• Tremblay E, Thibault MP, Ferretti E, Babakissa C, Bertelle V, Bettolli M, Burghardt K, Colombani JF, Grynspan D, Levy E, Lu P,Mayer S, Ménard D, Mouterde O, Renes IB, Seidman EG, Beaulieu JF. (2016). Gene expression profiles in necrotizing enterocolitis reveals pathways common to those reported in Crohn's disease. BMC Med Genomics, 9(1), 6. (Published).
• Klionsky DJ, et al. (2016). Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (3rd edition). Autophagy, 12(1), 1-222. (Published).
• Boudjadi S, Carrier JC, Groulx JF, Beaulieu JF. (2016). Integrin ?1?1 expression is controlled by c-MYC in colorectal cancer cells. Oncogene, 35(13), 1671-1678. (Published).
• Boudjadi S, Beaulieu JF. (2016). MYC and integrins interplay in colorectal cancer. Oncoscience, 3(2), 50-51. (Published).
• Sénicourt B, Boudjadi S, Carrier JC, Beaulieu JF. (2016). Neoexpression of a functional primary cilium in colorectal cancer cells. Heliyon, 2(5), e00109. DOI. (Published).
• Mayeur S, Veilleux A, Pouliot Y, Lamarche B, Beaulieu JF, Hould FS, Richard D, Tchernof A, Levy E. (2016). Plasma Lactoferrin Levels Positively Correlate with Insulin Resistance despite an Inverse Association with Total Adiposity in Lean and Severely Obese Patients. PLoS One, 11(11), e0166138. (Published).
• Beaulieu JF, Herring E, Kanaoka S, Tremblay É. (2016). Use of integrin alpha 6 transcripts in a stool mRNA assay for the detection of colorectal cancers at curable stages. Oncotarget, 7(12), 14684-14692. (Published).
• Veilleux A, Mayeur S, Bérubé JC, Beaulieu JF, Tremblay E, Hould FS, Bossé Y, Richard D, Levy E. (2015). Altered intestinal functions and increased local inflammation in insulin-resistant obese subjects: a gene-expression profile analysis. BMC Gastroenterology, 15(1), 119. (Published).
• Marcil V , Amre D , Seidman EG , Boudreau F , Gendron FP , Ménard D , Beaulieu JF , Sinnett D , Lambert M , Levy E. (2015). Hepatocyte Nuclear Factor 4 Alpha Polymorphisms and the Metabolic Syndrome in French-Canadian Youth. PloS one, 10(2), e0117238. (Published).
• Roostaee A, Guezguez A, Beauséjour M, Simoneau A, Vachon PH, Levy E, Beaulieu JF. (2015). Histone Deacetylase Inhibition Impairs Normal Intestinal Cell Proliferation and Promotes Specific Gene Expression. J Cell Biochem., 116(11), 2695-2708. (Published).
• Beaulieu JF. (2015). Tuning WNT-?-catenin signaling via BCL9 proteins for targeting colorectal cancer cells. EBioMedicine, 2(12), 1846-1847. (Published).
• Harmel E , Grenier E , Bendjoudi Ouadda A , El Chebly M , Ziv E , Beaulieu JF , Sané A , Spahis S , Laville M , Levy E. (2014). AMPK in the Small Intestine in Normal and Pathophysiological Conditions. Endocrinology, 155(3), 873-888. (Published).
• Groulx JF , Giroux V , Beauséjour M , Boudjadi S , Basora N , Carrier JC , Beaulieu JF. (2014). Integrin ?6A splice variant regulates proliferation and the Wnt/?-catenin pathway in human colorectal cancer cells. Carcinogenesis, 35, 1217-1227. (Published).
• Guezguez A , Paré F , Benoit YD , Basora N , Beaulieu JF. (2014). Modulation of stemness in a human normal intestinal epithelial crypt cell line by activation of the WNT signaling pathway. Experimental cell research, 322, 355-364. (Published).
• Levy E, Spahis S, Garofalo C, Marcil V, Montoudis A, Sinnet D, Sanchez R, Peretti N, Beaulieu JF, Sane A. (2014). Sar1b transgenic male mice are more susceptible to high-fat diet-induced obesity, insulin-insensitivity and intestinal chylomicron overproduction. J Nutr Biochem, 25(5), 540-548. (Published).
• Boudjadi S , Bernatchez G , Beaulieu JF , Carrier JC. (2013). Control of the human osteopontin promoter by ERR? in colorectal cancer. The American journal of pathology, 183(1), 266-276. (Published).
• Perron N , Tremblay E , Ferretti E , Babakissa C , Seidman EG , Levy E , Ménard D , Beaulieu JF. (2013). Deleterious effects of indomethacin in the mid-gestation human intestine. Genomics, 101(3), 171-177. (Published).
• Sabra G , Dubiel EA , Kuehn C , Khalfaoui T , Beaulieu JF , Vermette P. (2013). INS-1 cell glucose-stimulated insulin secretion is reduced by the downregulation of the 67?kDa laminin receptor. Journal of tissue engineering and regenerative medicine, 2013, DOI: 10.1002/term.16. (Published).
• Boudjadi S, Carrier JC, Beaulieu JF. (2013). Integrin alpha1 subunit is upregulated in colorectal cancer. Biomarker Research, 1(1), 16. (Published).
• Yara S , Lavoie JC , Beaulieu JF , Delvin E , Amre D , Marcil V , Seidman E , Levy E. (2013). Iron-ascorbate-mediated lipid peroxidation causes epigenetic changes in the antioxidant defense in intestinal epithelial cells: impact on inflammation. PloS one, 8(5), e63456. (Published).
• Khalfaoui T, Groulx JF, Sabra G, Basora N, Vermette P, Beaulieu JF. (2013). Laminin receptor 37/67LR regulates adhesion and proliferation of normal human intestinal epithelial cells. PLoSOne, 8, e74337. (Published).
• Levy E , Ben Djoudi Ouadda A , Spahis S , Sane AT , Garofalo C , Grenier É , Emonnot L , Yara S , Couture P , Beaulieu JF , Ménard D , Seidah NG , Elchebly M. (2013). PCSK9 plays a significant role in cholesterol homeostasis and lipid transport in intestinal epithelial cells. Atherosclerosis, 227(2), 297-306. (Published).
• Benoit YD , Witherspoon MS , Laursen KB , Guezguez A , Beauséjour M , Beaulieu JF , Lipkin SM , Gudas LJ. (2013). Pharmacological inhibition of polycomb repressive complex-2 activity induces apoptosis in human colon cancer stem cells. Experimental cell research, 319(10), 1463-1470. (Published).
• Venables JP , Brosseau JP , Gadea G , Klinck R , Prinos P , Beaulieu JF , Lapointe E , Durand M , Thibault P , Tremblay K , Rousset F , Tazi J , Abou Elela S , Chabot B. (2013). RBFOX2 Is an Important Regulator of Mesenchymal Tissue-Specific Splicing in both Normal and Cancer Tissues. Molecular and cellular biology, 33(2), 396-405. (Published).
• Seltana A , Guezguez A , Lepage M , Basora N , Beaulieu JF. (2013). Src family kinase inhibitor PP2 accelerates differentiation in human intestinal epithelial cells. Biochemical and biophysical research communications, 430(4), 1195-1200. (Published).
• Beauséjour M , Thibodeau S , Demers MJ , Bouchard V , Gauthier R , Beaulieu JF , Vachon PH. (2013). Suppression of anoikis in human intestinal epithelial cells: differentiation state-selective roles of ?2?1, ?3?1, ?5?1, and ?6?4 integrins. BMC cell biology, 14(1;14:53.), 1-19. (Published).
• Bustin SA , Benes V , Garson J , Hellemans J , Huggett J , Kubista M , Mueller R , Nolan T , Pfaffl MW , Shipley G , Wittwer CT , Schjerling P , Day PJ , Abreu M , Aguado B , Beaulieu JF , Beckers A , Bogaert S , Browne JA , Carrasco-Ramiro F , Ceelen L , Ciborowski K , Cornillie P , Coulon S , Cuypers A , De Brouwer S , De Ceuninck L , De Craene J , De Naeyer H , De Spiegelaere W , Deckers K , Dheedene A , Durinck K , Ferreira-Teixeira M , Fieuw A , Gallup JM , Gonzalo-Flores S , Goossens K , Heindryckx F , Herring E , Hoenicka H , Icardi L , Jaggi R , Javad F , Karampelias M , Kibenge F , Kibenge M , Kumps C , Lambertz I , Lammens T , Markey A , Messiaen P , Mets E , Morais S , Mudarra-Rubio A , Nakiwala J , Nelis H , Olsvik PA , Pérez-Novo C , Plusquin M , Remans T , Rihani A , Rodrigues-Santos P , Rondou P , Sanders R , Schmidt-Bleek K , Skovgaard K , Smeets K , Tabera L , Toegel S , Van Acker T , Van den Broeck W , Van der Meulen J , Van Gele M , Van Peer G , Van Poucke M , Van Ro. (2013). The need for transparency and good practices in the qPCR literature. Nature methods, 10(11), 1063-1067. (Published).
• Ménard D , Tremblay E , Ferretti E , Babakissa C , Perron N , Seidman EG , Levy E , Beaulieu JF. (2012). Anti-inflammatory effects of epidermal growth factor on the immature human intestine. Physiological genomics, 44(4), 268-280. (Published).
• Précourt LP , Marcil V , Ntimbane T , Taha R , Lavoie JC , Delvin E , Seidman EG , Beaulieu JF , Levy E. (2012). Antioxidative properties of paraoxonase 2 in intestinal epithelial cells. American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology, 303(5), G623-G634. (Published).
• Marcil V , Sinnett D , Seidman E , Boudreau F , Gendron FP , Beaulieu JF , Menard D , Lambert M , Bitton A , Sanchez R , Amre D , Levy E. (2012). Association between genetic variants in the HNF4A gene and childhood-onset Crohn's disease. Genes and immunity, 13(7), 556-565. (Published).
• Groulx JF , Khalfaoui T , Benoit YD , Bernatchez G , Carrier JC , Basora N , Beaulieu JF. (2012). Autophagy is active in normal colon mucosa. Autophagy, 8(6), 893-902. (Published).
• Beauséjour M , Noël D , Thibodeau S , Bouchard V , Harnois C , Beaulieu JF , Demers MJ , Vachon PH. (2012). Integrin/Fak/Src-mediated regulation of cell survival and anoikis in human intestinal epithelial crypt cells: selective engagement and roles of PI3-K isoform complexes. Apoptosis : an international journal on programmed cell death, 17(6), 566-578. (Published).
• Beaulieu JF , Ménard D. (2012). Isolation, characterization, and culture of normal human intestinal crypt and villus cells. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 806, 157-173. (Published).
• Chailler P , Beaulieu JF , Ménard D. (2012). Isolation and functional studies of human fetal gastric epithelium in primary culture. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 806, 137-155. (Published).
• Benoit YD , Lepage MB , Khalfaoui T , Tremblay E , Basora N , Carrier JC , Gudas LJ , Beaulieu JF. (2012). Polycomb repressive complex 2 impedes intestinal cell terminal differentiation. Journal of cell science, 125(Pt 14), 3454-3463. (Published).
• Benoit YD , Groulx JF , Gagné D , Beaulieu JF. (2012). RGD-Dependent Epithelial Cell-Matrix Interactions in the Human Intestinal Crypt. Journal of signal transduction, 2012, 248759. (Published).
• Groulx JF , Gagné D , Benoit YD , Martel D , Basora N , Beaulieu JF. (2011). Collagen VI is a basement membrane component that regulates epithelial cell-fibronectin interactions. Matrix biology : journal of the International Society for Matrix Biology, 30(3), 195-206. (Published).
• Tremblay E , Ferretti E , Babakissa C , Seidman EG , Levy E , Ménard D , Beaulieu JF ,. (2011). Gene-expression profile analysis in the mid-gestation human intestine discloses greater functional immaturity of the colon as compared with the ileum. Journal of pediatric gastroenterology and nutrition, 52(6), 670-678. (Published).
• Benoit YD , Paré F , Francoeur C , Jean D , Tremblay E , Boudreau F , Escaffit F , Beaulieu JF. (2010). Cooperation between HNF-1alpha, Cdx2, and GATA-4 in initiating an enterocytic differentiation program in a normal human intestinal epithelial progenitor cell line. American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology, 298(4), G504-G517. (Published).
• Gagné D , Groulx JF , Benoit YD , Basora N , Herring E , Vachon PH , Beaulieu JF. (2010). Integrin-linked kinase regulates migration and proliferation of human intestinal cells under a fibronectin-dependent mechanism. Journal of cellular physiology, 222(2), 387-400. (Published).
• Beaulieu JF. (2010). Integrin ?6?4 in colorectal cancer. World journal of gastrointestinal pathophysiology, 1(1), 3-11. (Published).
• Benoit YD , Larrivée JF , Groulx JF , Stankova J , Vachon PH , Beaulieu JF. (2010). Integrin alpha8beta1 confers anoikis susceptibility to human intestinal epithelial crypt cells. Biochemical and biophysical research communications, 399(3), 434-439. (Published).
• Seltana A , Basora N , Beaulieu JF. (2010). Intestinal epithelial wound healing assay in an epithelial-mesenchymal co-culture system. Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society, 18(1), 114-122. (Published).
• Marcil V , Seidman E , Sinnett D , Boudreau F , Gendron FP , Beaulieu JF , Ménard D , Precourt LP , Amre D , Levy E. (2010). Modification in oxidative stress, inflammation, and lipoprotein assembly in response to hepatocyte nuclear factor 4alpha knockdown in intestinal epithelial cells. The Journal of biological chemistry, 285(52), 40448-40460. (Published).
• Basora N , Tétreault MP , Boucher MP , Herring E , Beaulieu JF. (2010). Polycystin-1 is a microtubule-driven desmosome-associated component in polarized epithelial cells. Experimental cell research, 316(9), 1454-1464. (Published).
• Dydensborg AB , Teller IC , Basora N , Groulx JF , Auclair J , Francoeur C , Escaffit F , Paré F , Herring E , Ménard D , Beaulieu JF. (2009). Differential expression of the integrins alpha6Abeta4 and alpha6Bbeta4 along the crypt-villus axis in the human small intestine. Histochemistry and cell biology, 131(4), 531-536. (Published).
• Lévy E , Delvin E , Ménard D , Beaulieu JF. (2009). Functional development of human fetal gastrointestinal tract. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 550, 205-224. (Published).
• Benoit YD , Lussier C , Ducharme PA , Sivret S , Schnapp LM , Basora N , Beaulieu JF. (2009). Integrin alpha8beta1 regulates adhesion, migration and proliferation of human intestinal crypt cells via a predominant RhoA/ROCK-dependent mechanism. Biology of the cell, 101(12), 695-708. (Published).
• Levy E , Ménard D , Delvin E , Montoudis A , Beaulieu JF , Mailhot G , Dubé N , Sinnett D , Seidman E , Bendayan M. (2009). Localization, function and regulation of the two intestinal fatty acid-binding protein types. Histochemistry and cell biology, 132(3), 351-357. (Published).

Livres

• Several (22 chapters). (2018). Colorectal Cancer: Overviews and Methods (Methods in Molecular Biology, 1765). United States : Springer. (Published).

Chapitres de livre

• Falah S, Sénicourt B, Beaulieu JF. (2020). Proliferation in the Gastrointestinal Epithelium. Kuipers, EJ Encyclopedia of Gastroenterology (2 nd, 4, 304-310). United States : Oxford: Academic Press. (Published).
• Herring E, Kanaoka S, Beaulieu JF. (2018). Multi-target Stool mRNA Test for the Detection of Colorectal Lesions. Beaulieu JF Colorectal Cancer (Methods in Moleculr Biology, 1-10). United States : Springer - Humana Press. (In Press).
• Seltana A, Lepage M, Beaulieu JF. (2012). Alteration of crypt epithelial-stromal interface by pro-inflammatory cytokines in Crohn's disease. S. Karoui Crohn's Disease (3-16). Croatia : InTech Open Access. (Published).
• Seltana A, Basora N, Beaulieu JF. (2012). Caco-2 cells as an experimental model to study cell-matrix interactions and wound healing on intestinal villus cells. Schulz MA Caco-2 Cells and Their Uses (77-88). United States : Nova Sciences. (Published).
• Beaulieu JF, Ménard D. (2012). Isolation, characterization and culture of normal human intestinal crypt and villus cells. R Mitry & R. Hughes Methods in Molecular Biology, Human Cell Culture Protocols (3 rd, 157-173). United States : Humana Press. (Published).
• Chailler P, Beaulieu JF, Ménard D. (2012). Isolation and functional studies of human fetal gastric epithelium in primary culture. R Mitry & R. Hughes Methods in Molecular Biology, Human Cell Culture Protocols (3 rd, 137-155). United States : Humana Press. (Published).
• Carrier JC, Beaulieu JF. (2010). Vers un meilleur dépistage des maladies colorectales. Le Guide des tendances 2010 (35-37). Canada : Isabelle Quentin Editeur. (Published).
• Beaulieu JF. (2009). Des percées à prévoir dans le traitement des maladies digestives. Le Guide des tendances 2009 (82-83). Canada : Isabelle Quentin. (Published).
• Levy E, Delvin E, Ménard D, Beaulieu JF. (2009). Functional development of the human fetal gastrointestinal tract. Lafond J and Vaillancourt C Human Embryogenesis: Methods and Protocols (205-224). United States : Humana Press. (Published).
• Ménard D, Beaulieu JF, Boudreau F, Perreault N, Rivard N, Vachon PH. (2009). Gastrointestinal tract. Unsicker K and Kriglstein K Cell Signaling and Growth Factor in Development. From Molecules to Organogenesis (755-790). Germany : Wiley-VCH. (Published).
• Beaulieu, J.F. (2001). Role of extracellular matrix proteins on human intestinal cell functions. Laminin-epithelial cell interactions. Delvin EE and Lentze MJ Gastrointestinal functions (59-75). United States : Vevey/Lippincott Williams & Wilkins. (Published).
• Bouatrouss, Y., Poisson, J. and Beaulieu, J.F. (1998). Ch. 17, Studying the basement membrane. (Preedly V.R. and Watson, R.R. In Methods in Disease: Investigating the Gastrointestinal Tract (191-200). United Kingdom : Greenwich Medical Media Ltd. (Published).
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Articles de conférence

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Propriétés intellectuelles

Patents

• Beaulieu JF, Basora N, Herring E and Groulx JF. (2015). PROLIFERATION-ASSOCIATED MODULATION OF THE SPLICING OF THE INTEGRIN ALPHA 6 ISOFORMS. US #2011/0301,227, # 2015/0276,743. United States. (Pending).
• Beaulieu JF, Basora N, Herring E and Groulx JF. (2013). PROLIFERATION-ASSOCIATED MODULATION OF THE SPLICING OF THE INTEGRIN ALPHA 6 ISOFORMS. 09831355.4 EUROPE. France. (Pending).
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Licenses

• Licence for inclusion of HIEC-6 cells in the regular cell collection at the American Type Culture Collection (ATCC). Available in May 2016 Cat # CRL-3266. (2016). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec Lund University (Dr. M. Ohlin) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 02/2016). (2016). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec Università degli Studi di Catanzaro (Italy) (Dr. R. Amato) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 01/2016). (2016). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec Dana Farber Cancer Institute à Boston (Dr. D.W. Kufe) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 04/2015). (2015). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec Virginia Commonwealth University à Richmond (Dr. A. Ivanov) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 04/2015). (2015). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec McMaster University à Hamilton (Drs. E. Verdue and M. Jordana) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 02/2015). (2015). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec McMaster University à Hamilton (Drs. M. Bhatia and Y. Benoit) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 01/2015). (2015). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec Harvard University à Boston (Dr. R. Mostoslavsky) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 12/2014). (2014). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la Columbia University à New York (Dr. D. Accili) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 010/2014). (2014). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le CRCHUQ-Hotel-Dieu de Québec (Dr. M.E. Huot) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 02/2014). (2014). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Unité 1037 INSERM (Centre de recherche sur le cancer de Toulouse) (Dr. A. Ferrand) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 01/2014). (2014). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Agence nationale de sécurité saniatire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES) de Fougère (Dr. V. Fessard) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 12/2013). (2013). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Michigan Technological Univeristy à Houghton (Dr. A. Deshpande) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 11/2013). (2013). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Tufts University à Boston (Dr. David Kaplan) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2013). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Tech.. Chinese Academy of sciences (Dr. Bo Liang) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2013). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le CR Cordeliers, France (Dr Monique Rousset) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of Cambridge (Prof Ian Goodfellow) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Lancaster University UK(Dr Rachael Rigby) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Univeristy of California Davis (Dr Bo Lonnerdal) pour l'utilisation des cellules HIEC (Beaulieu; 04/2012). (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Michigan State University (Dr Marc Basson)pour l'utilisation des cellules HIEC. (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Osaka University (Dr Hiroyuki Mizuguchi)pour l'utilisation des cellules HIEC. (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Italien NCI (Dr Milena Nicoloso)pour l'utilisation des cellules HIEC. (2012). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le MIT (Dr William Thily)pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of Pennsylvania (Dr Anil Rustgi) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Institute of Molecular Genetics, Czech Republic (Dr Bohumil Fafilek) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le UT Southwestern Medical Center -Dalls, Texas (Dr Jerry Shay)pour l'utilisation de nos vecteurs d'expression encodant Cdx2, HNF-1a et GATA-4 humains. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University North Carolina –Chapel Hill (Dr Ralph Baric) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Erasmus MC-Sophia Children's Hospital, Rotterdam (Dr Ingrid B. Renes) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec School of Medicine, Yale University, New Haven (Dr YangChi Cheng) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of Michigan Medical School, Ann Arbor (Dr Christiane Wobus) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2011). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of North Carolina at Chapel Hill, Chapel Hill, NC (Dr Patricial K. Lund) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2010). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Ohio State University, Colombus, Ohio (Dr Linda Saif) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2010). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Centre de recherche de l'Hôtel-Dieu - Université Laval (Dr Jacques Huot) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Swedish Univ. Agri. Sci., Arrheniusplan, Sweeden (Dr Erik Ulleras) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Dalhousie (Dr Kirill Rosen) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Montréal (Dr Sylvain Meloche) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université Montpellier II, Cedex (Dr Caroline Laurent) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la Queen's University, Kingston (Dr R. John MacLeod) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la University of Mariboru, Slovenia (Dr Walter Chingwaru) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le VUmc-Cancer Resrearch Center Amsterdam, The Netherlands (Dr Connie Jimenez) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la Université Médicale Graz, Autriche (Dr Sanja Levak-Frank) pour l'utilisation des cellules Caco-2/15. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Texas Medical School, USA (Dr Xiyun Deng) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2009). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec Yale University, USA (Drs Wing Lam and Y.C. Cheng) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Milan, Italie (Dr Silvia Garoboldi/Cristiano Rumio) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Nice-Sophia Antipolis-INSERM, France (Dr Valérie Vouret-Craviari) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Charity University de Berlin, Allemagne, (Drs Andreas Fisher and Franz Theuring) pour l'utilisation des construction pGL3 contenant les promoteurs humains de la claudine 2 et de la claudine 4. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Herlev Hospital Copenhagen, Denmark (Dr Oliver Broom) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la Western Virginia University, USA (Dr Steven Fritch) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la Chinese University of Hong Kong (Dr Martin Chan) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Tongji Medical College, Chine, (Prof. Zhi-Yong Huang) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'INSERM-UMR620, Rennes (Dr Marie-Thérèse Dimanche-Boitel) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Albert Einstein College of Medicine, Bronx, NY (Dr Sridhar Mani) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2008). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l' INSERM-UJF U83, Grenoble (Dr Muriel Jacquier-Sarlin) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2007). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec la Cleveland Clinic Foundation, Cleveland USA (Dr Nywana Sizemore) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2007). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Tokyo Medical and Dental University, Tokyo, Japan (Dr. Kiichiro Tsuchiya) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2007). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Czech Academy of Sciences, Prague, Czech Republic (Dr. Ladislav Andera) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2007). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Montréal (Dr. Edward Bradley) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2007). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University Medical Center Utrecht, Utrecht, The Netherland (Dr. Onon Kranenburg). (2007). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le CNRS UMR 5089, Toulouse (Dr Nadine Puget) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Chemotherapeutisches Forschungsinstitut (Allemagne), (Dr. Ina Oehme) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le The Beatson Institute for Cancer Research, Glasgow, UK, (Dr. Amardeep S. Dhillon) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l' INSERM Unité 793 (Hôpital Necker-Enfants Malades), France, (Dr. Frank Ruemmele & Dr. Cerf-Bensussan) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l' Université Dalhousie (Dr Andrew W. Stadnyk) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l' Université Kingston, (Dr Mark J. Ropeleski) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l' Université Paul Sabatier, Toulouse (Dr Fabrice Escaffit) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Bourgogne, France, (Prof. Olivier Micheau) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Bourgogne, France, (Prof. Olivier Micheau) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2006). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Cincinnati Children's Hospital Medical Center (Dr. Woody Benson and Kista Clark) pour l'utilisation de la construction PLNCX2-GATA4 humain. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of New South Wales, Australia, (Dr. Beng H. Chong) pour l'utilisation de la construction PLNCX2-GATA4 humain dans les cellules humaines. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of New South Wales, Australia, (Dr. Beng H. Chong) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'ISERM U567 ADR Paris V-Sainte-Anne, (Prof. Frederic Bulle) pour l'utilisation de la construction PLNCX2-GATA4 humain dans les cardiomyocytes. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Liège, Belgique, (Prof. G. Dandrifosse) pour l'utilisation de la construction PLNCX2-E-cadhérine humaine dans des cellules intestinale bovines. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Children's Hospital Boston (Dr Steve Krasinski) pour l'utilisation de la construction PLNCX2-GATA4 humain. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of Florida Board of Trustees (Dr John F. Valentine) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Medical University of South Carolina (Dr Shibnath Ghatak) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2005). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Bordeaux 2 (UMR CNRS 5164; Dr Julie Déchanet-Merville pour l'utilisation des cellules HIEC. (2004). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Panum Institute of Denmark (Dr Jesper Troelsen) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2004). (Granted).
• Échange technologique (licence) avec Kinetana (Canada)pour l'utilisation des cellules HIEC. (2004). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of Florida Board of Trustees (Dr John F. Valentine) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2003). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le University of Gissen, Germany, (Dr Clemens Kunz) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2003). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Cedars-Sinai Medical Center , California, (Dr. Kosta A. Papadakis) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec le Lady Davis Institute – Jewish General Hospital, Montréal (Dr Laurence Panasci) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université Harvard (Dr. N. Nanda Nanthakumar) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Toronto (Dr Jorge Filmus) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Toronto (Dr Jorge Filmus) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université d'Alberta (Dr Timothy Kieffer) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (licence) avec TELOGENE (Canada) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2002). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec University of Oulu (Dr Seppo Parkkila) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2001). (Granted).
• Échange technologie avec Adherex (Ottawa) pour l'analyse de peptides neutralisants pour les interactions cellules-cellules. (2001). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'UQAM (Dr Catherine Jumarie) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2000). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Univerité de Lund (Dr William Agace) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2000). (Granted).
• Échange technologique (licence) avec NUMICO (Pays-Bas) pour l'utilisation des cellules HIEC. (2000). (Granted).
• Brevet international pour l'isolement, la culture et les essais biologiques sur les cellules épithéliales du tube digestif obtenues avec la technique du Matrisperse. (1999). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'INSERM (Jean-François LAUNAY) pour l'utilisation des cellules HIEC. (1999). (Granted).
• Échange technologique (MTA) avec l'Université de Bonn (Dr. Frank M. Ruemmele) pour l'utilisation des cellules HIEC et Caco-2/15. (1999). (Granted).
• Échanges technologiques avec Clonetics (BioWittaker) pour la commercialisation des cellules HIEC. (1998). (Granted).