Sébastien Roy

Prix et distinctions

• (2018) Grande distinction en enseignement universitaire – volet équipe. Université de Sherbrooke.
• (2000) Mention of excellence for thesis defence. Université de Sherbrooke.

Financement

• Subvention. Étude fonctionnelle d'espèces indigènes à la Fosse du Labrador et leur potentiel en restauration minière durable. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 300 000 $. (2025-2028).
• Subvention. Actinorhizal plant-microbe interactions in challenging environments. CRSNG (Ottawa, Canada). 195 000 $. (2025-2030).
• Subvention. Centre SÈVE – regroupement stratégique FRQNT. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 6 000 000 $. (2024-2030).
• Subvention. Mise en œuvre de l'initiative "healing the land" pour la consolidation des connaissances et l'implantation concertée de pratiques en restauration minière valorisant le patrimoine vivant du Territoire Eeyou Istchee. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Montreal, Canada). 300 000 $. (2023-2026).
  Numéro de subvention : 340427. Voir plus
• Subvention. Étude des végétaux rustiques de la Fosse du Labrador pour adresser l'érosion éolienne et établir un couvert végétal sur les parcs à résidus nordiques. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 300 000 $. (2021-2026). Voir plus
• Subvention. Développement d'une approche intégrative de restauration minière valorisant le patrimoine vivant du Territoire Eeyou Istchee. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 300 000 $. (2020-2024). Voir plus
• Subvention. Identifying species and planting conditions to revegetate mixed mine tailings at the Whabouchi site operated by Nemaska Lithium in Northern Québec. Mitacs (Vancouver, Canada). 30 000 $. (2019-2020).
• Subvention. Acquisition of a Fluorescence and Chemiluminescence Imaging Platform. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 53 588 $. (2019-2020).
  Numéro de subvention : RTI-2020-00424. Voir plus
• Subvention. Alder-microbe interactions and adaptations in changing environments. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et en Génie du Canada (Ottawa, Canada). 140 000 $. (2019-2025).
• Subvention. Accelerating innovations to adapt agro-environments to climate change: The Eastern Canadian Plant Phenotyping Platform. Canada Foundation for Innovation (Ottawa, Canada). 9 519 419 $. (2017).
  Numéro de subvention : 36219. Voir plus
• Subvention. Centre SÈVE – regroupement stratégique. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 2 880 000 $. (2017-2023).
• Subvention salariée. Appui salarial à un poste de professionnelle de recherche. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 16 500 $. (2017-2018).
• Subvention. Land capitalization through the use of indigenous woody species from Southern Québec. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et en Génie du Canada (Ottawa, Canada). 24 916 $. (2017).
• Subvention. Vehicles and mobile laboratory for field research in ecology / Véhicules et laboratoire mobile pour la recherche de terrain en écologie. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 110 651 $. (2016-2017).
  Numéro de subvention : RTI-2017-00352. Voir plus
• Subvention. Développement d'une approche durable de restauration progressive d'extrants miniers mixtes (stériles et résidus) des nouvelles mines du Nord Québecois; les espèces végétales indigènes à la rencontre des besoins des communautés cries. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Montreal, Canada). 305 169 $. (2016-2019).
  Numéro de subvention : 202330. Voir plus
• Subvention. Afforestation/reforestation for the sustainable mineland reclamation and greenhouse gas management in the Canadian mining sector. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 358 062 $. (2016-2019).
  Numéro de subvention : 488866-2015. Voir plus
• Subvention. Centre SÈVE : Centre de recherche en sciences du végétal. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 809 600 $. (2015-2017).
• Subvention. Heavy metal filtration by vegetation on gold mine tailings: prediction and testing using naturally-occuring and introduced vegetation. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 25 000 $. (2014-2015).
  Numéro de subvention : 474768-2014. Voir plus
• Subvention. Acquisition of a Fluorescence-Activated Cell Sorter (FACS). Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 150 000 $. (2014-2015).
  Numéro de subvention : 472742-2015. Voir plus
• Subvention. Développement de techniques de réhabilitation écologique prédictives: étude de la sélection naturelle d'arbres et herbacées (sur 50 ans) sur un dépôt de résidus acidogènes. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Montreal, Canada). 304 902 $. (2014-2018).
  Numéro de subvention : 193427. Voir plus
• Subvention. Prédictions critiques en revégétalisation de résidus acidogènes: effet des symbioses plantes-microorganismes sur la translocation des métaux et mécanismes assurant le maintien de l'homéostasie chez l'aulne dans ces environnements. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Montreal, Canada). 302 310 $. (2013-2017).
  Numéro de subvention : 182949. Voir plus
• Subvention. Caractérisation et culture axénique d'un mycète truffier indigène du Québec. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 23 281 $. (2013-2014).
  Numéro de subvention : 454936-2013. Voir plus
• Subvention. Établissement et évaluation de la symbiose actinorhizienne chez l'aulne produit en serre industrielle. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 24 998 $. (2013-2014).
  Numéro de subvention : 453638-2013. Voir plus
• Subvention. La revégétalisation comme outil d'intervention et de rétablissement des services écosystémiques sur les sites miniers non-acidogènes. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Montreal, Canada). 305 059 $. (2013-2017).
  Numéro de subvention : 182932. Voir plus
• Subvention. Développement de technologies de revégétalisation de haldes et résidus miniers acidogènes:exploitation de plantes symbiotiques et de biomasse industrielle résiduelle. consortium de recherche et innovation en bioprocédés industriels au Québec (Québec, Canada). 121 650 $. (2013-2015).
• Subvention. "Adaptation of Frankia, alders, and their symbiosis to environmental stress. Adaptation au stress environnemental de Frankia, des aulnes et de leur symbiose.". Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 125 000 $. (2012-2017).
  Numéro de subvention : 330361-2012. Voir plus
• Subvention. Multi-elemental analyser to support applied and fundamental research in plant and soil ecology / Analyseur multi-élémentaire pour la recherche en écologie des plantes et du sol. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 56 203 $. (2012-2013).
  Numéro de subvention : grant.2930556. Voir plus
• Subvention. Centre SÈVE : Centre de recherche en sciences du végétal. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 450 000 $. (2012-2015).
• Subvention. Réduction concomittante des gaz à effet de serre et d'odeurs provenant d'un lieu d'enfouissement sanitaire par des biorecouvrements. Consortium de recherche et innovations en bioprocédés industriels au Québec (Québec, Canada). 77 078 $. (2011-2013).
• Subvention. Centre d'étude et de valorisation de la diversité microbienne. PFIR: Prog. interne de fin. des infrastructures de recherche (Sherbrooke, Canada). 34 456 $. (2011-2012).
• Subvention. Unlocking the biotechnological potential of Frankia: reclaiming Canada's mine waste-affected lands using symbiotic alders. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 186 142 $. (2011-2014).
  Numéro de subvention : 428919-2011. Voir plus
• Subvention. Échanges génétiques chez Frankia en présence de stress environnemental: une étude sur les éléments intégratifs et conjugatifs (ICE). Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Montreal, Canada). 170 100 $. (2011-2014).
  Numéro de subvention : 148753. Voir plus
• Subvention. Centre SÈVE : Centre de recherche en sciences du végétal. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 1 518 000 $. (2011-2012).
• Subvention. ANR-Biological filtration to reduce trace elements in woody biomass. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 541 500 $. (2010-2013).
  Numéro de subvention : grant.2925602. Voir plus
• Subvention. Système d'imagerie digitale. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 20 166 $. (2010-2011).
  Numéro de subvention : grant.2923474. Voir plus
• Subvention. Purchase of growth chambers for studying micronutrient dynamics at the soil-plant interface. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 122 205 $. (2010-2011).
  Numéro de subvention : grant.2855535. Voir plus
• Subvention. Acquisition of an ultracentrifuge / Acquisition d'une ultracentrifugeuse. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 149 806 $. (2010-2011).
  Numéro de subvention : grant.2891369. Voir plus
• Subvention. Développement de techniques permettant la manipulation génétique de Frankia sp. Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 33 000 $. (2010-2012).
• Subvention. Automated instrument for timecourse metabolic studies of bacteria. Systeme automatise pour l'etude dynamique du metabolisme bacterien. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 126 565 $. (2009-2010).
  Numéro de subvention : grant.2801120. Voir plus
• Subvention. Transcriptomic study of the cellular differentiation in Frankia sp. (reproductive torulose hyphae). Fonds de Recherche du Québec – Nature et Technologies (Québec, Canada). 13 500 $. (2009-2010).
• Subvention. Sustainable management of oil sands tailings using actinorhizal alder technology: large-scale field trials involving global impact studies and the optimization/expansion of existing operational parameters. Ministère de l'Énergie et des Ressources naturelles (Québec, Canada). 400 000 $. (2008-2012).
• Subvention. Actinomycorrhizal alder technology development for the rehabilitation of disturbed ecosystems in the oil sands industry of Alberta. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 199 998 $. (2007-2009).
  Numéro de subvention : grant.2846847. Voir plus
• Subvention. Appareillage pour l'électrophorèse en gradient dénaturant chimique ou thermique. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 14 039 $. (2007-2008).
  Numéro de subvention : grant.2934199. Voir plus
• Subvention. Study of the impact of anthropogenic stress on frankia sp., alders, and their symbiosis. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 100 000 $. (2007-2012).
  Numéro de subvention : grant.2931333. Voir plus
• Subvention. Establishment of an environmental microbiology laboratory / Établissement d'un laboratoire de microbiologie environnementale. Canada Foundation for Innovation (Ottawa, Canada). 100 036 $. (2006).
  Numéro de subvention : 12765. Voir plus
• Subvention. Automated bioreactor system allowing gas control and analysis. Natural Sciences and Engineering Research Council (Ottawa, Canada). 51 021 $. (2006-2007).
  Numéro de subvention : grant.2805113. Voir plus
• Subvention. Centre d'étude et de valorisation de la diversité microbienne. Université de Sherbrooke (Sherbrooke, Canada). 163 181 $. (2006-2011).

Publications

Articles

• Malo, S., Lamothe, C., Laforest-Lapointe, I., Roy, S., Bellenger, J.-P. (2025). Evaluation of the potential of bryophytes to support seedlings development on waste rocks: a mesocosm study. Canadian Journal of Soil Science. DOI
• Sarah Ishak, Jonathan Rondeau-Leclaire, Maria Faticov, Sébastien Roy, Isabelle Laforest-Lapointe. (2024). Boreal moss-microbe interactions are revealed through metagenome assembly of novel bacterial species. Scientific Reports. DOI
• Liu, C., Pouliot, K., Roy, S., Rochefort, L. (2024). Moss regeneration for lithium mine waste rock revegetation in Québec, Canada. Botany. DOI
• Garneau, L., Beauregard, P.B., Roy, S. (2023). Deciphering the role of non-Frankia nodular endophytes in alder through in vitro and genomic characterization. Canadian Journal of Microbiology. DOI
• Garneau, L., Beauregard, P.B., Roy, S. (2023). Neighbours in nodules: the interactions between Frankia sp. ACN10a and non-Frankia nodular endophytes of alder. Canadian Journal of Microbiology. DOI
• Mohr, J.F., Gama, S., Roy, S., Bellenger, J.-P., Plass, W., Wichard, T. (2022). Hydroxypyridinones in nitrogen-fixing bacterial cultures: A metal buffer for molybdenum and simulation of natural conditions. Metallomics. DOI
• Leroux, J., Charron-Lamoureux, V., Roy, S., Beauregard, P.B., Bellenger, J.-P. (2020). Bacillus subtilis Modulates Its Usage of Biofilm-Bound Iron in Response to Environmental Iron Availability. Applied and Environmental Microbiology. DOI
• Gagnon, V., Rodrigue-Morin, M., Tardif, A., Beaudin, J., Greer, C.W., Shipley, B., Bellenger, J.-P., Roy, S. (2020). Differences in elemental composition of tailings, soils, and plant tissues following five decades of native plant colonization on a gold mine site in Northwestern Québec. Chemosphere. DOI
• Mohr, J.F., Weiss, A., Roy, S., Wichard, T. (2020). Genome sequence of Frankia sp. Strain CH37, a metallophore-producing, nitrogen-fixing actinobacterium isolated from the sea buckthorn, Hippophae rhamnoides (Elaeagnaceae). Microbiology Resource Announcements. DOI
• Gagnon, V., Rodrigue-Morin, M., Tremblay, J., Wasserscheid, J., Champagne, J., Bellenger, J.-P., Greer, C.W., Roy, S. (2020). Life in mine tailings: Microbial population structure across the bulk soil, rhizosphere, and roots of boreal species colonizing mine tailings in northwestern Québec. Annals of Microbiology. DOI
• Gagnon, V., Rodrigue-Morin, M., Migneault, M., Tardif, A., Garneau, L., Lalonde, S., Shipley, B., Greer, C.W., Bellenger, J.-P., Roy, S. (2020). Survival, growth and element translocation by 4 plant species growing on acidogenic gold mine tailings in Québec. Ecological Engineering. DOI
• Gagnon, V., Rodrigue-Morin, M., Tremblay, J., Wasserscheid, J., Champagne, J., Bellenger, J.-P., Greer, C.W., Roy, S. (2020). Vegetation drives the structure of active microbial communities on an acidogenic mine tailings deposit. Peerj. DOI
• Steve Lalancette, Sylvain Lerat, Sébastien Roy, Carole Beaulieu. (2019). Fungal Endophytes of Alnus incana ssp. rugosa and Alnus alnobetula ssp. crispa and Their Potential to Tolerate Heavy Metals and to Promote Plant Growth. Mycobiology. DOI
• Rizzi, A., Roy, S., Bellenger, J.-P., Beauregard, P.B. (2019). Iron homeostasis in Bacillus subtilis requires siderophore production and biofilm formation. Applied and Environmental Microbiology. DOI
• Deicke, M., Mohr, J.F., Roy, S., Herzsprung, P., Bellenger, J.-P., Wichard, T. (2019). Metallophore profiling of nitrogen-fixing: Frankia spp. to understand metal management in the rhizosphere of actinorhizal plants. Metallomics. DOI
• Tardif, A., Rodrigue-Morin, M., Gagnon, V., Shipley, B., Roy, S., Bellenger, J.-P. (2019). The relative importance of abiotic conditions and subsequent land use on the boreal primary succession of acidogenic mine tailings. Ecological Engineering. DOI
• Callender, K.L., Roy, S., Khasa, D.P., Whyte, L.G., Greer, C.W. (2016). Actinorhizal alder phytostabilization alters microbial community dynamics in gold mine waste rock from northern Quebec: A greenhouse study. PLoS ONE. DOI
• Beaudoin-Nadeau, M., Gagné, A., Bissonnette, C., Bélanger, P.-A., Fortin, J.A., Roy, S., Greer, C.W., Khasa, D.P. (2016). Performance of ectomycorrhizal alders exposed to specific Canadian oil sands tailing stressors under in vivo bipartite symbiotic conditions. Canadian Journal of Microbiology. DOI
• Pourhassan, N., Bruno, Sé., Jewell, M.D., Shipley, B., Roy, Sé., Bellenger, J.-P. (2016). Phosphorus and micronutrient dynamics during gymnosperm and angiosperm litters decomposition in temperate cold forest from Eastern Canada. Geoderma. DOI
• Allard, N., Garneau, D., Poulin-Laprade, D., Burrus, V., Brzezinski, R., Roy, S. (2015). A diaminopimelic acid auxotrophic Escherichia coli donor provides improved counterselection following intergeneric conjugation with actinomycetes. Canadian Journal of Microbiology. DOI
• Bélanger, P.-A., Bellenger, J.-P., Roy, S. (2015). Heavy metal stress in alders: Tolerance and vulnerability of the actinorhizal symbiosis. Chemosphere. DOI
• Pourhassan, N., Wichard, T., Roy, S., Bellenger, J.-P. (2015). Impact of elevated CO2 on metal homeostasis and the actinorhizal symbiosis in early successional alder shrubs. Environmental and Experimental Botany. DOI
• Bissonnette, C., Fahlman, B., Peru, K.M., Khasa, D.P., Greer, C.W., Headley, J.V., Roy, S. (2014). Symbiosis with Frankia sp. Benefits the establishment of Alnus viridis ssp. Crispa and Alnus incana ssp. Rugosa in tailings sand from the Canadian oil sands industry. Ecological Engineering. DOI
• Bélanger, P.-A., Bellenger, J.-P., Roy, S. (2013). Strong modulation of nutrient distribution in Alnus glutinosa as a function of the actinorhizal symbiosis. Botany. DOI
• Bélanger, P.-A., Bissonnette, C., Bernèche-D'Amours, A., Bellenger, J.-P., Roy, S. (2011). Assessing the adaptability of the actinorhizal symbiosis in the face of environmental change. Environmental and Experimental Botany. DOI
• Bélanger, P.-A., Beaudin, J., Roy, S. (2011). High-throughput screening of microbial adaptation to environmental stress. Journal of Microbiological Methods. DOI
• Bernèche-D'Amours, A., Ghinet, M.G., Beaudin, J., Brzezinski, R., Roy, S. (2011). Sequence analysis of rpoB and rpoD gene fragments reveals the phylogenetic diversity of actinobacteria of genus Frankia. Canadian Journal of Microbiology. DOI
• Ghinet, M.G., Bordeleau, E., Beaudin, J., Brzezinski, R., Roy, S., Burrus, V. (2011). Uncovering the prevalence and diversity of integrating conjugative elements in actinobacteria. PLoS ONE. DOI
• Ghinet, M.G., Roy, S., Poulin-Laprade, D., Lacombe-Harvey, M.-E., Morosoli, R., Brzezinski, R. (2010). Chitosanase from Streptomyces coelicolor A3(2): Biochemical properties and role in protection against antibacterial effect of chitosan. Biochemistry and Cell Biology. DOI
• Lefrançois, E., Quoreshi, A., Khasa, D., Fung, M., Whyte, L.G., Roy, S., Greer, C.W. (2010). Field performance of alder-Frankia symbionts for the reclamation of oil sands sites. Applied Soil Ecology. DOI
• Roy, S., Khasa, D.P., Greer, C.W. (2007). Combining alders, frankiae, and mycorrhizae for the revegetation and remediation of contaminated ecosystems. Canadian Journal of Botany. DOI
• Roy, S., Fortin, M., Gagnon, J., Ghinet, M.G., LeHoux, J.-G., Dupuis, G., Brzezinski, R. (2007). Quantitative fluorometric analysis of the protective effect of chitosan on thermal unfolding of catalytically active native and genetically-engineered chitosanases. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics. DOI
• Roy, S., Labelle, S., Mehta, P., Mihoc, A., Fortin, N., Masson, C., Leblanc, R., Châteauneuf, G., Sura, C., Gallipeau, C., Olsen, C., Delisle, S., Labrecque, M., Greer, C.W. (2005). Phytoremediation of heavy metal and PAH-contaminated brownfield sites. Plant and Soil. DOI
• Roy, S., Gendron, J., Delhoménie, M.-C., Bibeau, L., Heitz, M., Brzezinski, R. (2003). Pseudomonas putida as the dominant toluene-degrading bacterial species during air decontamination by biofiltration. Applied Microbiology and Biotechnology. DOI
• Delhoménie, M.-C., Bibeau, L., Bredin, N., Roy, S., Broussau, S., Brzezinski, R., Kugelmass, J.L., Heitz, M. (2002). Biofiltration of air contaminated with toluene on a compost-based bed. Advances in Environmental Research. DOI
• Roy, S., Mysior, P., Brzezinski, R. (2002). Comparison of dioxin and furan TEQ determination in contaminated soil using chemical, micro-EROD, and immunoassay analysis. Chemosphere. DOI
• Labrie, C., Leclerc, P., Côté, N., Roy, S., Brzezinski, R., Hogue, R., Beaulieu, C. (2001). Effect of chitin waste-based composts produced by two-phase composting on two oomycete plant pathogens. Plant and Soil. DOI
• Delhoménie, M.-C., Bibeau, L., Roy, S., Brzezinski, R., Heitz, M. (2001). Influence of nitrogen on the degradation of toluene in a compost-based biofilter. Journal of Chemical Technology and Biotechnology. DOI
• Roy, S., Leclerc, P., Auger, F., Beaulieu, C., Brzezinski, R., Soucy, G., Moresoli, C., Côté, L., Potvin, D. (1997). A novel two-phase composting process using shrimp shells as an amendment to partly composted biomass. Compost Science and Utilization. DOI

Chapitres de livre

• Simao-Beaunoir, A.-M., Roy, S., Beaulieu, C. (2009). Microbial traits associated with actinobacteria interacting with plants. Molecular Plant-Microbe Interactions.

Articles de conférence

• Becherrani, A.*, Bellenger, J-P., Cardou, F., Chagnon, P-L, Laforest-Lapointe, I., Roy, S. (2025). Étude de l'acclimatation de semis boréaux en contexte de restauration écologique minière. Québec Mines et Énergie 2025.
• Garneau, L*; Théau, J; Roy, S. (2024). Chiffrer la verdure - nature, couverture et ce qu'elle endure. Journées Centre SÈVE 2024.
• Robitaille, L*; Guglielmetti, M*; Garneau, L*; Beaudin, J*; Shipley, B; Bellenger, J-P; Laforest-Lapointe, I; Chagnon, P-L; Roy, S. (2024). Effets de la colonisation végétale sur les indicateurs de qualité de sol des résidus miniers du site abandonnée Lac Jeannine. Québec Mines + Énergie 2024.
• Guglielmetti, M*; Robitaille, L*; Garneau, L*; Beaudin, J*; Shipley, B; Bellenger, J-P; Laforest-Lapointe, I; Roy, S; Chagnon, P-L. (2024). Interactions plantes-sol en restauration écologique: Comprendre le rôle du microbiome dans la restauration des habitats endommagés. Québec Mines + Énergie 2024.
• Garneau L*, Théau J, Roy S. (2023). 40 ans plus tard : déchiffrer un désert au coeur de la forêt boréale. Québec Mines + Énergie 2023.
• Garneau L*, Roy, S. (2023). Whabouchi revegetation project. Nemaska land and environment conference.
• Alix-Paré O*, Garneau L*, Malo S*, Rochefort L, Bellenger J-P, Laforest-Lapointe I, Shipley B, Roy S. (2023). Étude de l'acclimatation de plantes indigènes au territoire Eeyou Istchee pour la restauration minière: un pas vers la durabilité écologique. Québec Mines + Énergie 2023.
• Malo S*, Roy S, Laforest-Lapointe I, Bellenger J-P. (2023). Évaluation de la contribution des mousses à la survie et la croissance de semis en contexte de revégétalisation minière. Québec Mines + Énergie 2023.
• Alix-Paré O*, Garneau L*, Malo S*, Rochefort L, Bellenger J-P, Laforest-Lapointe I, Shipley B, Roy S. (2022). Acclimatation de plantes indigènes au territoire Eeyou Istchee pour la restauration minière. Québec Mines + Énergie 2022.
• Garneau L, Roy S. (2022). Désert boréal: les facteurs limitants la revégétalisation naturelle du parc à résidus fins d'une ancienne mine de fer. Québec Mines + Énergie 2022.
• Malo S*, Alix-Paré O*, Roy S, Laforest-Lapointe I, Rochefort L, Bellenger J-P. (2022). Les bryophytes, une solution à l'importante mortalité en revégétalisation de site minier?. Québec Mines + Énergie 2022.
• Ishak S*, Roy S, Laforest-Lapointe I. (2022). Of Microbiomes and Mosses: Exploring the functional diversity of the boreal mossmicrobiome from the Eeyou Istchee region of Québec. Canadian Botanical Association 2022 Annual Conference, 'When Maths meets Botany'.
• Ishak, S*, Roy S, Laforest-Lapointe I. (2022). Of Microbiomes and Mosses: Exploring the functional diversity of the boreal mossmicrobiome from the Eeyou Istchee region of Québec. 15e Colloque du CEF (Centre d'étude de la forêt), 'Sols et mousses' session.
• Ishak S*, Roy S, Laforest-Lapointe I. (2022). Of Microbiomes and Mosses: Exploring the functional diversity of the boreal mossmicrobiome from the Eeyou Istchee region of Québec. ESA-CSEE 2022 General Meeting, 'Moss Ecology in a Changing World',.
• Liu C*, Pouliot K, Rochefort L, Roy S. (2022). Pioneer moss regeneration for mine waste rocks revegetation. Science Symposium PERG & SER-EC.
• Liu C*, Pouliot K, Rochefort L, Roy S. (2022). Pioneer moss regeneration for mine waste rocks revegetation. Québec Mines + Énergie 2022.
• Liu C*, Pouliot K, Rochefort L, Roy S. (2022). Pioneer moss regeneration for mine waste rocks revegetation. Sentinel North.
• Garneau L*, Lalonde S*, Beauregard PB, Roy S. (2019). Alder bacterial endophytes and their interactions: a symbiotic symphony. 69th annual conference of the Canadian Society of Microbiologists.
• Lalonde S*, Roy S. (2019). Améliorer le pouvoir biofertilisant de la symbiose actinorhizienne en étudiant la composition du microbiome nodulaire. 40e Québec Mines + Énergie.
• Garneau L*, Lalonde S*, Beauregard PB, Roy S. (2019). Des arbustes robustes et leurs locataires racinaires : une conjugaison synergique pour la revégétalisation minière. 40e Québec Mines + Énergie.
• Chelo C*, Shipley JW et Roy S. (2019). L'utilisation des traits fonctionnels dans la sélection de végétaux indigènes pour la restauration progressive du site Whabouchi de Nemaska Lithium. 40e Québec Mines + Énergie.
• Lalonde S*, Roy S. (2019). MicromonosporaInvestigating the occurence of in nodules and rhizosphere of actinorhizal plants in Québec, Canada. 69th annual conference of the Canadian Society of Microbiologists.
• Canton Ruz A*, Migneault M*, Roy S et Shipley B. (2019). Utilisation de la phytométrie pour évaluer la fertilité des résidus miniers: une alternative offrant une réponse plus globale et représentative que les analyses agronomiques conventionnelles. 40e Québec Mines + Énergie.
• Bouchard-Jean, F*; Paré, M; Roy, S; Boucher, J-F. (2018). Early response of vegetation and soils to organic amendments of a reforested mine tailings site. ESA Annual Meeting.
• Tardif A*, Cajolet-Boisclair H, Shipley B, Roy S. (2018). Importance des mycorhizes dans la revégétalisation naturelle d'un ancien site minier aurifère au Canada. Colloque international. 5èmes Journées Francophones des Mycorhizes. Université du Littoral Côte d'Opale.
• Garneau L*. (2018). Un nouveau système de culture végétale gnotobiotique en matrice transparente pour l'observation non destructive du système racinaire d'aulnes actinorhiziens. Les journées du Centre SÈVE.
• Rizzi A*, Haroune L*, Roy S, Bellenger J-P, Beauregard PB. (2017). Biofilm and bacillibactin are essential to iron homeostasis in Bacillus subtilis. 19th International Conference on Bacillus and related Gram-positive bacteria.
• Gagnon V*, Rodrigue-Morin M*, Greer CW, Roy S. (2017). Colonisation naturelle d'un site minier aurifère sur 50 ans: comparaison des populations microbiennes, de la structure élémentaire du sol et du potentiel de translocation de métaux lourds dans les plantes. Québec Mines 2017.
• Roy S, Lalonde S*, Bélanger P-A, Garneau L*, Barrette K, Migneault M. (2017). Comment exploiter les principes de succession végétale et les associations microbiennes pour réussir sa réhabilitation minière à faible coût, sans amendement et sans préparation du site?. Québec Mines 2017.
• Lalancette S*, Beaulieu C, Roy S. (2017). Isolement et sélection d'endophytes fongiques pour la phytostabilisation des métaux lourds dans le sol. Québec Mines 2017.
• Lalonde S*, Roy S. (2017). L'exploitation de microorganismes indigènes pour améliorer la survie et le développement de plantes pionnières lors de la réhabilitation de sites perturbés. Québec Mines 2017.
• Garneau L*, Beauregard PB, Roy S. (2017). Le microbiome racinaire: un outil prometteur pour améliorer la performance des arbustes indigènes employés pour la réhabilitation minière au Québec Récipiendaire du prix: Prix (1ère place) du Défi de la recherche en géosciences de L'AQUEST. Québec Mines 2017.
• Gagnon V*, Greer CW, Roy S. (2017). Populations microbiennes des sols et composition élémentaire des végétaux colonisant un site minier aurifère depuis cinq décennies. Journées du Centre SÈVE.
• Rodrigue-Morin M*, Gagnon V*, Bellenger J-P, Roy S. (2017). Potentiel de translocation et de toxicité du drainage minier acide envers l'aulne, un arbuste de choix en restauration minière. Québec Mines 2017.
• Lalonde S*, Roy S. (2017). Réponse à court terme de l'aulne par la co-inoculation de leurs endophytes. Journées du Centre SÈVE.
• Tardif A*, Shipley B, Chelo C*, Bellenger J-P, Roy S. (2017). Rétablissement autonome de la biodiversité boréale sur les sites miniers : l'importance relative des conditions du substrat et perturbations humaines. Québec Mines 2017.
• Greer CW, Callender K*, Tremblay J, Champagne J, Roy S, Bois G, Khasa DP. (2016). Applying genomics to monitor plant-microbe symbiosis during land reclamation at a gold mine. Canadian Institute of Mining, Metallurgy and Petroleum Conference.
• Rizzi A*, Roy S, Beauregard PB, Bellenger J-P. (2016). Bacillus subtilisLe biofilm, un acteur essentiel de la gestion du fer chez. Journées du Centre Sève.
• Rizzi A*, Roy S, Beauregard PB, Bellenger J-P. (2016). Bacillus subtilisLow intracellular iron concentration triggers biofilm formation. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME).
• Gagnon V*, Roy S, Greer CW. (2016). Dynamique des populations microbiennes sous les arbres et arbustes ayant naturellement colonisé un site minier aurifère inactif depuis plusieurs décennies. Québec Mines 2016.
• Lalonde S*, Garneau L*, Barrette K*, Migneault M, Roy S. (2016). La réhabilitation minière à faible coût et à faible empreinte de carbone; l'exploitation des principes de succession végétale et des associations plantes-microorganismes pour la revégétalisation sans amendement et sans préparation du site. Québec Mines 2016.
• Gagnon V*, Roy S, Greer CW. (2016). Microbial ecology of native plants colonizing mine tailings. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME).
• Garneau L*, Roy S. (2016). Neighbours in nodules: investigating microbial populations in alder root nodules and their plant growth-promotion potential. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME).
• Rodrigue-Morin M*, Barrette K*, Roy S. (2016). Potentiel de translocation et de toxicité de résidus miniers acidogènes envers les espèces végétales et microbiennes indigènes. Québec Mines 2016.
• Tardif A*, Shipley B, Roy S. (2016). Revégétalisation naturelle d'un site minier par les traits fonctionnels de plante. Colloque annuel du Centre de la Science de la Biodiversité du Québec (CSBQ).
• Tardif A*, Shipley W, Roy S. (2016). Rétablissement autonome de la biodiversité boréale sur les sites miniers: une approche d'ingénierie inverse basée sur l'assemblage de traits fonctionnels. Québec Mines 2016.
• Barrette K*, Darnajoux R, Bellenger J-P, Roy S. (2016). Symbionts under metal stress: microelemental management in actinorhizal alder exposed to mine tailings. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME).
• Garneau L*, Roy S. (2016). Vers la pleine exploitation du microbiome de nos arbustes indigènes pour optimiser leur développement sur les sites miniers les plus hostiles. Récipiendaire du prix : Prix (3ème place) du Défi de la recherche en géosciences de l'AQUEST. Québec Mines 2016.
• Allard N*, Burrus V, Brzezinski R, Roy S. (2015). A diaminopimelic acid auxotrophic donor strain allows intergeneric conjugation with nalidixic acid-sensitive actinobacteria. 18th International Meeting on Frankia and Actinorhizal Plants.
• Khasa DP, Greer CW, Quoreshi A, Gagné A, Aziez A*, Bulin S, Fortin JA, Callender K*, Juck D, Beaudin J, Bélanger P-A, Bissonnette C*, Roy S. (2015). Actinorhizal research in Québec (Canada) and applications in land reclamation of severely disturbed sites. 18th International Meeting on Frankia and Actinorhizal Plants.
• Garneau L*, Bissonnette C*, Corbeil M-M*, Mallet P-L*, Beaudin J, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2015). Case studies in Alberta and Quebec reclamation sites: how low-cost nursery inoculants for pioneer shrubs reduce reclamation costs, accelerate CO2 capture, and derive nitrogen from thin air. 10th International Conference on Mine Closure.
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• Allard N*, Poulin-Laprade D*, Burrus V, Brzezinski R, Roy S. (2014). Improvement of counterselection technique following intergeneric conjugation with actinomycetes using a donor strain auxotrophic for diaminopimelic acid (DAP). IUMS 2014 - Union internationale des sociétés de microbiologie 14th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 14th International congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology, 16th International Congress of Virology.
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• Nadeau MB, Aziez A*, Roy S, Greer CW, Khasa DP. (2014). Picea glaucaDevelopment of a new green technology for the revegetation of abandoned gold mine tailings using specific symbiotic microorganisms associated with. 9th International Conference on Mine Closure.
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• Ghinet MG, Roy S, Brzezinski R, Burrus V. (2010). Molecular structure of actinomycete integrating conjugative elements (AICEs) in soil-dwelling actinobacteria of the genus Frankia. 110th General Meeting of the American Society for Microbiology.
• Bissonnette C*, Mallet P-L*, Greer CW, Roy S. (2010). Tolerance of alder and its actinorhizal symbiont Frankia to Alberta oil sands residues. ISME 13th International Symposium on Microbial Ecology.
• Bélanger P-A*, Roy S. (2010). Utilisation d'aulnes symbiotiques pour la revégétalisation des sites contaminés par les métaux: mission possible!. Colloque annuel du Centre SÈVE.
• Bernèche-D'Amours A*, Ghinet MG, Beaudin J, Brzezinski R, Roy S. (2010). rpoB and rpoD gene fragments as new tools in assessing phylogenetic diversity of genus Frankia. ISME 13th International Symposium on Microbial Ecology.
• Bélanger P-A*, Roy S. (2009). Effect of heavy metal toxicity on Frankia sp. and its symbiosis with black alder (Alnus glutinosa (L.) Gaertn). XIV International Congress On Molecular Plant-Microbe Interactions (MPMI).
• Bélanger P-A*, Roy S. (2009). Effects of Heavy Metal Toxicity on the Survival of the Nitrogen-Fixing Bacteria Frankia sp. 109th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM).
• Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2009). Impact of Oil Sand Exploitation Activities in Alberta on Frankia sp.-Alder Symbiosis. 109th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM).
• Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2009). Impact of Tailing Sand on the Establishment of the Frankia sp.-Alder Symbiosis. XIV Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions (MPMI).
• Bélanger P-A*, Roy S. (2009). Impact of heavy metals on the symbiosis of Frankia and black alder (Alnus glutinosa (L.) Gaertn). 59th Annual Conference of the Canadian Society of Microbiologists (CSM).
• Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2009). Impact of salts and naphthenic acids from the oil sands industry on the metabolism of the nitrogen-fixing alder symbiont Frankia sp. 59th Annual General Meeting of the Canadian Society of Microbiologists (CSM).
• Greer CW, Lefrançois E*, Quoreshi A, Khasa DP, Fung M, Whyte LG, Roy S. (2008). Alder-Frankia symbionts enhance the remediation and revegetation of oil sands tailings. Petroleum Technology Alliance Canada (PTAC) Forum.
• Quoreshi A, Lefrançois E*, Fung M, Roy S, Greer CW, Khasa DP. (2008). Microbial Biotechnology Enhances the Reclamation of Disturbed Lands in the Oil Sands Industry. Canadian Land Reclamation Association National Conference.
• Bernèche D'amours A*, Beaudin J, Gagnon J, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Beaulieu C, Roy S. (2008). Revégétalisation de sites perturbés par l'activité industrielle; évaluation de méthodes alternatives pour l'inoculation d'aulnes avec Frankia sp. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF).
• Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2008). Un mariage plante-microorganisme afin de revégétaliser les sols perturbés de l'Alberta. Journée de la recherche (U. Sherbrooke).
• Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2008). Étude de l'impact du stress anthropogénique retrouvé dans les sols bitumineux de l'Alberta sur le métabolisme de Frankia sp. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF).
• Bélanger P-A*, Roy S. (2008). Étude du stress anthropogénique causé par les métaux lourds chez Frankia sp. et sa symbiose avec l'aulne. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF).
• Bélanger P-A*, Roy S. (2008). Étude du stress microbien chez Frankia spp. en présence de métaux lourds contaminant l'environnement. Journée de la recherche (U. Sherbrooke).
• Greer CW, Lefrançois E*, Quoreshi A, Khasa DP, Fung M, Whyte LG, Roy S. (2007). Alder-Frankia symbionts enhance the remediation and revegetation of oil sands tailings. Remediation Technologies Symposium 2007.
• Gulgielmetti, M.*, Beaudin, J.*, Shipley, B., Bellenger, J-P, Laforest-Lapointe, I., Roy, S., Chagnon, P-L. L'impact des espèces végétales pionnières sur lasanté et les communautés microbiennes des sols dans la restauration écologiqued'un site minier dégradé. Québec Mines et Énergie 2025.

Articles de journal

• Sébastien Roy. (2024). Des serres ultramodernes pour étudier la santé des plantes voient le jour à l’UdeS. La Tribune.
• Sébastien Roy. (2020). La revégétalisation de Wabouchi est déjà débutée. Journal La Sentinelle.

Autres contributions

Cours enseignés à l'UdeS

• MCB602 - Microbiologie industrielle et biotechnologie. (2023-2026). (3CR).
• MCB510 - Microbiologie industrielle et biotechnologie. (2024-2025). (3CR).
• PBI702 - Séminaire de recherche II. (2023). (1CR).
• PBI706 - Séminaire de recherche IV. (2023). (1CR).
• PBI708 - Séminaire de recherche V. (2023). (1CR).

Divers

• (2013). Utilisation d'arbustes symbiotiques pour initier la revégétalisation de sites miniers en Alberta et au Québec. Colloque annuel de l'Association canadienne de réhabilitation des sites dégradés (Chapitre Québec), Bécancour.
• Fortin JA, Khasa DP, Piché Y, Roy S, Greer CW. (2012). Écoréhabiltation des sites fortement perturbés par des plantes actinomycorhiziennes : expériences québécoises?. 80e Congrès de l'Acfas, Montréal.
• (2014). La phytotechnologie: un moteur important pour le développement durable dans l'industrie minière. 18th annual meeting of the Chapitre Saint-Laurent (SETAC chapter), Québec.
• (2019). Développement d'approches durables en restauration minière au Québec: l'exploitation d'arbustes symbiotiques pour initier la végétalisation des résidus fins et des stériles. 40e Québec Mines + Énergie, Québec.
• (2015). Utilisation d'arbustes symbiotiques pour initier la revégétalisation de sites miniers en Alberta et au Québec. Americana 2015, Montréal.
• Ishak, S., Rondeau-Leclaire, J., Faticov, M., Roy, S., Laforest-Lapointe, I. (2023). Boreal moss-microbe interactions are revealed through metagenome assembly of novel bacterial species. Biorxiv.
• (2014). La végétation des haldes de stériles: défis, concepts et travaux en cours. Colloque des Nouvelles approches de traitement des eaux et de biorestauration de sites industriels, Orford.
• (2023). Development of tailored ecological restoration practices for the Whabouchi site. Nemaska land and environment conference, Nemaska, Eeyou-Istchee.
• (2008). L'actinorhize au 21e siècle: à la merci ou à la rescousse de l'activité industrielle?. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF), Québec.
• (2010). Frankia: de la biologie à la biotechnologie. Colloque annuel du Centre SÈVE, Orford.
• (2015). L'Université de Sherbrooke, partenaire pour la revégétalisation minière sans préparation du site. Québec Mines 2015, Québec.
• (2007). Étude de l'impact du stress anthropogénique sur Frankia et l'actinorhize. Colloque annuel du Centre SÈVE, Mont St-Hilaire.