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Biologie

A convenient analytic method for gel quantification using ImageJ paired with Python or R

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Auteurs et autrices

Cassidy Tomlinson, Ashwini Rajasekaran, Karine Brochu-Gaudreau, Claire Dubois, A James Farmilo, Pavel Gris, Ariane Khatiz, Amanda Matthews, Marjo Piltonen, Abdelaziz Amrani, Denis Gris

Noncanonical altPIDD1 protein: unveiling the true major translational output of the PIDD1 gene

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Auteurs et autrices 

Frédérick Comtois, Jean-François Jacques, Lenna Métayer, Wend Yam Dd Ouedraogo, Aïda Ouangraoua, Jean-Bernard Denault, Xavier Roucou

Deciphering the ghost proteome in ovarian cancer cells by deep proteogenomic characterization

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Auteurs et autrices 

Diego Fernando Garcia-Del Rio, Mehdi Derhourhi, Amelie Bonnefond, Sébastien Leblanc, Noé Guilloy, Xavier Roucou, Sven Eyckerman, Kris Gevaert, Michel Salzet, Tristan Cardon

High-quality peptide evidence for annotating non-canonical open reading frames as human proteins

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Auteurs et autrices 

Eric W Deutsch, Leron W Kok, Jonathan M Mudge, Jorge Ruiz-Orera, Ivo Fierro-Monti, Zhi Sun, Jennifer G Abelin, M Mar Alba, Julie L Aspden, Ariel A Bazzini, Elspeth A Bruford, Marie A Brunet, Lorenzo Calviello, Steven A Carr, Anne-Ruxandra Carvunis, Sonia Chothani, Jim Clauwaert, Kellie Dean, Pouya Faridi, Adam Frankish, Norbert Hubner, Nicholas T Ingolia, Michele Magrane, Maria Jesus Martin, Thomas F Martinez, Gerben Menschaert, Uwe Ohler, Sandra Orchard, Owen Rackham, Xavier Roucou, Sarah A Slavoff, Eivind Valen, Aaron Wacholder, Jonathan S Weissman, Wei Wu, Zhi Xie, Jyoti Choudhary, Michal Bassani-Sternberg, Juan Antonio Vizcaíno, Nicola Ternette, Robert L Moritz, John R Prensner, Sebastiaan van Heesch

Exploring the Alternative Proteome with OpenProt and Mass Spectrometry

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Auteurs et autrices

Nicolas Provencher, Sébastien Leblanc, Jean-François Jacques, Xavier Roucou

Hypoxia Promotes Invadosome Formation by Lung Fibroblasts

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Auteurs et autrices

Mégane Lebel, Dominic O Cliche, Martine Charbonneau, Karine Brochu-Gaudreau, Damien Adam, Emmanuelle Brochiero, Claire M Dubois, André M Cantin

Direct and indirect control of Rho-dependent transcription termination by the Escherichia coli lysC riboswitch

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Auteurs et autrices

Tithi Ghosh, Shirin Jahangirnejad, Adrien Chauvier, Anne M. Stringer, Alexey P. Korepanov, Jean-Phillippe Côté, Joseph T. Wade, Daniel A. Lafontaine

OpenProt 2.0 builds a path to the functional characterization of alternative proteins

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Auteurs et autrices

Sébastien Leblanc,† Feriel Yala,† Nicolas Provencher, Jean-François Lucier, Maxime Levesque, Xavier Lapointe, Jean-Francois Jacques, Isabelle Fournier, Michel Salzet, Aïda Ouangraoua, Michelle S Scott, François-Michel Boisvert, Marie A. Brunet, Xavier Roucou