Coordonnées

Courriel : Aida.Ouangraoua@USherbrooke.ca
Téléphone : 819 821-8000, poste 62014
Télécopieur : 819 821-8200
Local : D4-1010-7

Formation

M. Sc. Informatique et Génie Informatique, Université Bordeaux I, ENSEIRB (2004)
Ph. D. Informatique, Université Bordeaux I (2007)

Postdoctorat, Simon Fraser University (2008-2009)
Postdoctorat, Université du Québec à Montréal (2009)
Chargée de Recherche, Inria Lille (2009-2014) 

Thèmes de recherche

  • Algorithmique
  • Biologie computationnelle
  • Bioinformatique

Recherches actuelles

Développement de modèles et algorithmes pour l'analyse de processus biologiques :

  • Architecture de gènes, épissage, transcription alternative;
  • Évolution de génomes, réarrangements génomiques;
  • Structure d'ARN, annotation, détection de motifs;
  • Comparaison de structures arborescentes.

Publications

A. Perrin, J.-S.Varré, S. Blanquart, A. Ouangraoua. ProCARs: Progressive Reconstruction of Ancestral Gene Orders. BMC Genomics (2015). 16 (Suppl 5) : S6. http://dx.doi.org/10.1186/1471-2164-16-S5-S6

A. Ouangraoua, M. Raffinot. On the identification of conflicting contiguities in ancestral genome reconstruction. Journal of Computational Biology (2014) 21(1), pages 64-79. http://dx.doi.org/10.1089/cmb.2013.0086

A. Ouangraoua, K. Swenson, A. Bergeron. On the comparison of sets of alternative transcripts. International Symposium on Bioinformatics Research and Applications (ISBRA'12) (2012), LNCS 7292, pages 201-212. http://dx.doi.org/10.1007/978-3-642-30191-9_19