Daniel Lafontaine

Professeur titulaire

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Formation

B. Sc. (Biochimie), Université de Sherbrooke (1994)
Ph. D. Biochimie, Université de Sherbrooke (1999)

Postdoctorat, The University of Dundee, Écosse (1999-2002)

Thèmes de recherche

Plusieurs mécanismes de régulation sont connus pour réguler l'expression génétique lorsque des changements cellulaires surviennent. Ces mécanismes régulent au niveau de la transcription, la traduction et la stabilité de l'ARN messager. Au cours des dernières années, plusieurs découvertes ont révélé que la structure de certaines molécules d'ARN est souvent utilisée afin de contrôler la transcription de gènes essentiels chez les bactéries et les eucaryotes. Les riborégulateurs (riboswitch) sont des éléments de contrôle non-codant qui reconnaissent directement un métabolite cellulaire et qui régulent des gènes localisés en aval qui sont presque toujours associés à la biosynthèse ou le transport du métabolite reconnu. Les riborégulateurs fonctionnent sans l'aide de facteur protéique et sont essentiellement des senseurs métaboliques utilisant un système de rétro-inhibition afin de moduler les voies métaboliques de biosynthèse impliquées. Plus de 2% des gènes codant chez certaines bactéries sont sous le contrôle de riborégulateurs et la plupart de ces gènes sont essentiels à la survie de l'organisme. Il est donc très probable qu'en interférant avec la régulation des riborégulateurs, il soit possible d'empêcher la croissance d'une bactérie quelconque et ainsi obtenir un agent antimicrobien puissant.

Recherches actuelles

Dans notre laboratoire, nous étudions comment les métabolites cellulaires sont utilisés par les riborégulateurs afin d'effectuer leur régulation biologique. Un large éventail de techniques est utilisé afin de mesurer l'activité cellulaire des riborégulateurs et leurs mécanismes associés. De plus, nous sommes intéressés à comprendre comment le repliement de l'ARN est impliqué dans les mécanismes de régulation génétique. Ici, étant donné la nature inhérente des riborégulateur, nous utilisons la technique Fluorescence Resonance Energy Transfer (FRET) qui est l'une des techniques les plus puissantes pour étudier les changements de structures des riborégulateurs induits par la liaison d'un métabolite. Nous nous efforçons aussi à utiliser les notions apprises afin de développer de nouveaux éléments de contrôles génétiques.

Publications

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