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2 mai 2008
Pierre Masse

Succès mondial d’un nouvel outil de recherche en bio-informatique

Un programme informatique de la Faculté des sciences attire les biologistes de la planète

Le responsable du serveur CLUSS, Abdellali Kelil, doctorant en informatique, avec Ryszard Brzezinski, professeur au Département de biologie, et Shengrui Wang, professeur au Département d\'informatique.
Le responsable du serveur CLUSS, Abdellali Kelil, doctorant en informatique, avec Ryszard Brzezinski, professeur au Département de biologie, et Shengrui Wang, professeur au Département d\'informatique.

Un programme informatique unique au monde, mis au point au laboratoire de Prospection de données de l’Université de Sherbrooke (ProspectUS), aide les biologistes de la planète à découvrir de nouvelles fonctions pour les protéines.

Depuis son lancement il y a moins d’un an, les demandes d’accès au programme sont passées de 10 requêtes par mois à presque 1 000 requêtes par semaine depuis des centres de recherche au Japon, en Inde, aux Pays-Bas, aux États-Unis et de partout dans le monde. Ce programme de bio-informatique, appelé Cluss, est un outil ultra-puissant qui permet de traiter d’immenses quantités de données sur les protéines pour en extraire les informations pertinentes lorsque les méthodes statistiques classiques ne le permettent pas.

Trouver de nouvelles fonctions pour les protéines

Les protéines sont à la base du fonctionnement de l’organisme vivant. Les recherches internationales menées sur les protéines permettent par exemple d’enrayer la prolifération d’une bactérie ou encore d’évaluer les prédispositions à une maladie génétique. La détermination des liens entre les séquences génétiques des protéines et leurs fonctions sont essentielles aux chercheurs pour comprendre ce qui crée un être vivant et pour parvenir à rétablir cette fonction quand elle est défaillante. Auparavant, seules les séquences consécutives (alignées) de protéines étaient explorées. Grâce à l’exploration de données, aussi appelée forage, le programme Cluss permet d’établir des liens entre des séquences non alignées de protéines et les fonctions de ces dernières. Cluss offre donc aux chercheurs du monde entier la possibilité de découvrir des informations jusque-là inaccessibles.

L’article intégral du journal UdeS

liens complémentaires :

ProspectUS

Cluss

Baccalauréat en biotechnologie avec concentration en bio-informatique

Maîtrise en biologie cheminement de type recherche en bio-informatique

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