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Jean-François Ethier

Professeur, Faculté de médecine et des sciences de la santé
FMSS Département de médecine

Présentation

Sujet de recherche

Bioinformatics, Community Health / Public Health

Disciplines de recherche

Computer Science, Preventive and Community Medicine

Mots-clés

Learning health systems, Personalized medicine, Translational research, Interoperability, Data warehouses

Intérêts de recherche

Personalized medicine Pragmatic clinical trials Interoperability Data linkage Data mining

Centre de recherche

Centre de recherche du CHUS

Recherche clinique

Yes

Langues parlées et écrites

Anglais, Français

Diplômes

(2016). Intégration de ressources en recherche translationnelle : une approche unificatrice pour les systèmes de santé "apprenant" Mention : Très honorable (Doctorate, Epidemiologie et Sciences de L'Information Biomedicale). Université de Paris VI (P & M Curie).

(2011). Évaluation comparative de deux services terminologiques : LexEVS et Bioportal (Master's Equivalent, Master Sciences Technologie, Santé (STS) - Mention : Santé Publique). Université de Rennes I.

(2011). (Diploma, Medical Residency Training). McGill University.

(2006). (Diploma, MD CM). McGill University.

Titres de compétence

(2010) Spécialiste en médecine interne générale. Collège des médecins du Québec.

(2010) Médecine interne. Royal College of Physicians and Surgeons of Canada (The).

Expérience académique

Professeur chercheur-clinicien titulaire. (2023-). Université de Sherbrooke. Canada.

Directeur / Director Centre interdisciplinaire de recherche en informatique de la santé de l'Université de Sherbrooke (CIRIUS). (2020-2023). Université de Sherbrooke. Canada.

Professeur clinicien-chercheur agrégé. (2018-2023). Université de Sherbrooke. Canada.

Professeur adjoint, Département de médecine, Service de médecine interne. (2012-2018). Université de Sherbrooke. Canada.

Chercheur doctorant. (2011-2016). Institut national de la santé et de la recherche médicale. France.

Prix et distinctions

  • (2022) Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *Implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement 2017-2018-2019-2020-2021-2022. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Bourse J.W. McConnell Scholarship. McGill University. (Distinction).
  • Bourse J.W. McConnell Scholarship. McGill University. (Distinction).
  • Bourse James McGill Entrance Scholarship. McGill University. (Distinction).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list. McGill University. (Distinction).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Liste d'honneur du doyen / Dean's honor list *implication académique dans le décile supérieur pour les professeurs / top 10% for academic involvement. Université de Sherbrooke. (Honor).
  • Liste d'honneur du doyen à la graduation / Dean's honor list. McGill University. (Honor).
  • Premier prix, concours d'ontologie, FOIS 2014 // First place, ontology competition, FOIS 2014 - Cardiovascular disease ontology. International Association for Ontology and its Applications. (Prize / Award).

Financement

  • Grant. (Awarded). Co-applicant. Documenting the Essential Conditions for Implementing Urban Trails in Canada: A Novel Triangulation Approach. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Project grant. 1 900 000 $. (2023-2028)
  • Research Chair. (Awarded). Principal Applicant. Chaire de recherche en informatique de la santé de l’Université de Sherbrooke. Fondation de l'Univ. de Sherbrooke (Sherbrooke). Chaire de recherche. 550 000 $. (2022-2027)
  • Fellowship. (Awarded). Principal Applicant. Chercheur-clinicien Junior 2 (FRQS). (2023-2027)
  • Grant. (Awarded). Co-applicant. Mobilizing Knowledge and Implementing Equitable and Cost-Effective Health and Social Care Services for Persons Living with Diabetes in Canada. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). SPOR Networks – Knowledge Mobilization and Implementation Science. 3 750 000 $. (2022-2026)
  • Grant. (Awarded). Principal Applicant. Unité Soutien SSA Québec - Soutenir un système de santé apprenant, collaboratif, équitable et durable axé sur les patientes et les patients - direction de l'expertise Gestion des données optimisée, éthique et transparente. Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS). Boursiers FRQS-SRAP. 2 500 000 $. (2021-2026)
  • Grant. (Awarded). Principal Applicant. A Training Platform in Pragmatic Registry-Based Trials: Connecting Canada’s Health, Data, and Biomanufacturing Sectors. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Clinical Trials Fund (CTF). 3 479 319 $. (2022-2025)
  • Grant. (Awarded). Principal Applicant. Plateforme de données nationale de la SRAP / SPOR National Data Platform. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Other organisations (in kind). SRAP. 39 000 000 $. (2018-2025)
  • Grant. (Awarded). Co-applicant. Responsible Health and Healthcare Data Science. Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC). CREATE. 1 650 000 $. (2019-2025)
  • Grant. (Awarded). Co-applicant. Canadian Sepsis Research Network: Improving Care Before, During and After Sepsis. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Team Grant: Sepsis Research Network. 3 800 001 $. (2019-2024)
  • Grant. (Awarded). Collaborator. Phase Two of the Canadian Consortium on Neurodegeneration in Aging. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). program. 49 000 000 $. (2019-2024)
  • Fellowship. (Awarded). Principal Applicant. FRQS clinicien chercheur boursier Junior 1 - informatique et santé // FRQS clinical research scolar - health informatics. Fonds de recherche du Québec - Santé (FRQS). Établissement de jeunes chercheurs cliniciens. 136 363 $. (2018-2023)
  • Grant. (Awarded). Principal Applicant. Centre interdisciplinaire de recherche en informatique de la santé de l'Université de Sherbrooke. University of Sherbrooke. Centre de recherche. 120 000 $. (2020-2023)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. Réinventer les soins de santé (RSS) / ReImagining Healthcare (RIH) consortium. Autres organismes (In kind). Fonds stratégique pour l'innovation - Volet 4. 165 000 000 $. (2019-2023)
  • Contract. (Awarded). Principal Applicant. Système de gestion et de réaffectation des effectifs cliniques autonomes. Ministère de la Santé et des Services sociaux (Québec). COVID. 1 500 000 $. (2020-2023)
  • Contract. Principal Applicant. Centre d'expertise pour le numérique et les systèmes de santé apprenants de Sherbrooke (Censsas). Ministère de la Santé et des Services sociaux (Québec). 1 340 000 $. (2021-2023)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. SPOR Network in Diabetes and its Related Complications. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Partenaires privés / Private partners (in-kind). Réseau SRAP / SPOR Network. 5 623 723 $. (2016-2022)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. Developing a Vision and Strategic Plan to Support the Development and Implementation of a Big Data and Artificial Intelligence Research Agenda focusing on Cardiometabolic Disease, Diabetes and Obesity. Réseau de recherche FRQS en santé cardiométabolitique, diabète et obésité. Financement structurant. 95 480 $. (2020-2022)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Trajectoires de soins et conditions propices aux soins ambulatoires. Institut national de santé publique du Québec. Unité Soutien SRAP du Québec. Projet. 615 000 $. (2018-2022)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Le système de santé apprenant au service des malformations cardiaques congénitales : mise en oeuvre d’une collaboration interdisciplinaire transatlantique. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Programme projets structurants 2021 - CRCHUS. 62 500 $. (2021-2022)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. S'engager dans le monde avec nos partenaires. University of Sherbrooke. Programme des professeur.e.s invité.e.s. 2 400 $. (2022-2022)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. A learning health research system to bridge the gap between primary and specialized care.. University of Sherbrooke. INPRO. FCI Leader. 129 844 $. (2017-2022)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Supporting Canadians making emergent health decisions to focus on what matters most to them: establishing, testing, and scaling patient-oriented interventions.. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Project Grant - Priority Announcement: Patient-Oriented Research. 100 000 $. (2021-2022)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Les systèmes de santé apprenants de demain : apports de l'informatique de la santé, de la cybersécurité et de l'éthique de la recherche. Social Sciences and Humanities Research Council of Canada (SSHRC). Subvention Connexion. 8 000 $. (2020-2021)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. Privacy-Preserving Record Linkage: Testing and Potential Implementation in Canada. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Project Grant. 413 000 $. (2018-2021)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. Exercise as a countermeasure for inflammation processes and loss in neuromotor drive following muscle disuse: the SAFE randomized controlled trial.. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). Understanding the Health Impact of Inactivity / Subvention de fonctionnement: Comprendre les effets. 200 000 $. (2019-2021)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Fonds passerelle Unité de Soutien SRAP du Québec - composante Accès aux données. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). SPOR Support Unit. 6 067 878 $. (2020-2021)
  • Contract. (Awarded). Principal Applicant. Centre d'expertise pour le numérique et les systèmes de santé apprenants de Sherbrooke (Censsas). Ministère de la Santé et des Services sociaux (Québec). MSSS. 700 000 $. (2019-2021)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. Trajectoire de soins pharmaceutiques, entre les pharmaciens hospitalier et communautaire, chez les aînés - cohorte dans 1 région / Medication transitional care between hospital and community pharmacists for older adults - cohort in 1 region. Ministère de l'Économie et de l'Innovation du Québec. Créneau ACCORD. 96 700 $. (2019-2021)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Fonds passerelle Unité de Soutien SRAP du Québec - composante Accès aux données. Canadian Institutes of Health Research (CIHR). SPOR Support Unit. 1 247 838 $. (2019-2020)
  • Contract. (Completed). Principal Applicant. Développement d'une plateforme en support à l'apprentissage de la recherche pour les étudiants en médecine. University of Sherbrooke. FMSS. 60 000 $. (2019-2019)
  • Grant. (Completed). Principal Applicant. Unité SUPPORT du Québec : Un soutien pour la recherche axée sur le patient ( « Unité SOUTIEN SRAP-Qc »). (2014-2019)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. The Ovation-65 trial - Impact of permissive hypotension on end-organ damage in the elderly. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Chaire de recherche axée sur le patient en soins critiques. Projets structurants. 68 750 $. (2017-2018)
  • Fellowship. (Completed). Principal Applicant. Bourse salariale du CRCHUS / CHUS research center salarial support. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Bourse salariale. 50 000 $. (2017-2018)
  • Grant. (Completed). Co-applicant. The 65 trial: Linking bench to bedside. Centre de Recherche du Centre Hospitalier de l'Université de Sherbrooke Inc. (CRCHUS) (Sherbrooke, QC). Programme d'octoi de fonds de l'axe Santé - Populations, organisation, populations. 4 500 $. (2016-2017)
  • Grant. (Completed). Principal Investigator. Transfert de l’information électroniquement agrégée aux points de transition (TEAPOT)». Fondation du CHUS (Sherbrooke, QC). Fond Brigitte Perrault. 10 000 $. (2016-2017)
  • Grant. (Completed). Principal Investigator. Amélioration de la prescription médicamenteuse pour la personne âgée hospitalisée - Subventions Merck Sharpe & Dohme. (2014-2016)

Publications

Articles de revue

  • Annabelle Cumyn; Jean-Frédéric Ménard; Adrien Barton; Roxanne Dault; Frédérique Lévesque; Jean-François Ethier. (2023). Patients and Members of the Public’s Wishes Regarding Transparency in the Context of Secondary Use of Health Data: A Scoping Review. Journal of Medical Internet Research DOI. (In Press).
  • Madar, H., Ghandour, E.-K., Perez, J., Gauvin, L., Ethier, J.-F. et Pomey, M.-P. (2022). Adherence to diabetesclinical practice guidelines to improve prevention and treatment ofcardiovascular disease in Quebec: A retrospective cohort 2017-2020. Diabetes Epidemiology and Management 6 (100053), DOI. (Published).
  • Toyoshima, Fumiaki, Barton, Adrien, Ethier, Jean-François. (2022). Affordances and their ontological core. Applied Ontology 17 (2), 285-320. DOI. (Accepted).
  • Khnaisser, Christina; Lavoie, Luc; Fraikin, Benoit; Barton, Adrien; Dussault, Samuel; Burgun, Anita; Ethier, Jean-François. (2022). Using an Ontology to Derive a Sharable and Interoperable Relational Data Model for Heterogeneous Healthcare Data and Various Applications. Methods of Information in Medicine 61 (s2), e73-e88. DOI. (Published).
  • Thibaud Ecarot, Benoît Fraikin, Luc Lavoie, Mark McGilchrist and Jean-François Ethier. (2021). A Sensitive Data Access Model in Support of Learning Health Systems. Computers 10 (3), 25. DOI. (Published).
  • Taseen, R., Ethier, J-F. (2021). Expected Clinical Utility of Automatable Prediction Models for Improving Palliative and End-Of-Life Care Outcomes: Towards Routine Decision Analysis Before Implementation. Journal of the American Medical Informatics Association 140 1. (Published).
  • Annabelle Cumyn, Adrien Barton, Roxanne Dault, Nissrine Safa, Anne-Marie Cloutier, Jean-François Ethier. (2021). Meta-Consent for the Secondary Use of Health Data Within A Learning Health System: A Qualitative Study of the Public’s Perspective. BMC Medical ethics 22 81. DOI. (Published).
  • Ethier, J.-F., Goyer, F., Fabry, P. et Barton, A. (2021). The prescription of drug ontology 2.0 (PDRO):More than the sum of its parts. International Journal of Environmental Research and Public Health 18 (22), DOI. (Published).
  • Cumyn, A., Dault, R., Barton, A., Cloutier, A-M., Ethier, J-F. (2020). Citizens, research ethics committee members and researchers’ attitude toward information and consent for the secondary use of health data: Implications for research within learning health systems. Journal of Empirical Research on Human Research Ethics ahead of print ahead of print. DOI. (Published).
  • Lindsey Dahl, Alan Katz, Kimberlyn McGrail, Brent Diverty, Jean-Francois Ethier, Frank Gavin Chair, James Ted McDonald, P. Alison Paprica, Michael Schull, Jennifer D. Walker, Juliana Wu. (2020). The SPOR-Canadian Data Platform: a national initiative to facilitate data rich multi- jurisdictional research. International Journal of Population Data Science 5 (1), 1. DOI. (Published).
  • Cossette, B., Taseen, R., Roy-Petit, J., Villemure, M.-P., Grondin, M., Ricard, G., Goyer, F., Blanchard, C., Joly-Mischlich, T. et Ethier, J.-F. (2019). Apharmacist-physician intervention model using a computerized alert system toreduce high-risk medication use in primary care. European Journal of Clinical Pharmacology 75 (7), 1017-1023. DOI. (Published).
  • Cumyn A, Barton A, Dault R, Cloutier A-M, Jalbert R, Ethier J-F. (2019). Informed consent within a learning health system: A scoping review. Learning Health System Journal 4 (2), 1. DOI. (Published).
  • Jean-François Ethier, Adrien Barton & Ryeyan Taseen. (2018). An ontological analysis of drug prescriptions. Applied Ontology 13 (4), 273-294. (Published).
  • Christina Khnaisser, Luc Lavoie, Anita Burgun, Jean-Francois Ethier. (2018). Generating Relational Database using Ontology Review. International Journal of Advanced Computer Science and Applications 9 (6), 1. DOI. (Published).
  • Cossette, B., Taseen, R., Roy-Petit, J., Villemure, M., Grondin, M., Ricard, G., Goyer, F., Blanchard, T. et Ethier, J.-F. (2018). Reduction inpotentially inappropriate medication use in community-dwelling older adultsfollowed by a Family Health Team. Journal of the American Geriatrics Society 66 (S57), (Published).
  • A. Vanasse, M. Courteau, J-F. Ethier. (2018). The ‘6W’ multidimensional model of care trajectories for patients with chronic ambulatory care sensitive conditions and hospital readmissions. Public Health 157 (2018), 53-61. DOI. (Published).
  • Barton A., Ethier J.-F., Duvauferrier R., Burgun A. (2017). An ontological analysis of medical Bayesian indicators of performance. Journal of Biomedical Semantics 8 (1), 1. DOI. (Published).
  • Cossette B, Éthier JF, Joly-Mischlich T, Bergeron J, Ricard G, Brazeau S, Caron M, Germain O, Payette H, Kaczorowski J, Levine M. (2017). Reduction in targeted potentially inappropriate medication use in elderly inpatients: a pragmatic randomized controlled trial. European Journal of Clinical Pharmacology Epub ahead of print 1. DOI. (Published).
  • Jean-François Ethier, Mark McGilchrist, Adrien Barton, Anne-Marie Cloutier, Vasa Curcin, Brendan C. Delaney, Anita Burgun. (2017). The TRANSFoRm project: Experience and lessons learned regarding functional and interoperability requirements to support primary care. Learning Health Systems epub ahead of print 1. (Published).
  • JEthier, J.-F., Curcin, V., McGilchrist, M. M., Lim Choi Keung, S. N., Zhao, L., Andreasson, A., Bródka, P., Michalski, R., Arvanitis, T. N., Mastellos, N., Burgun, A. et Delaney, B. C. (2017). eSource for clinical trials: Implementation and evaluation of a standards-based approach in a real world trial. International Journal of Medical Informatics 106 17-24. DOI. (Published).
  • Cossette, B., Bergeron, J., Ricard, G., Ethier, JF., Joly-Mischlich, T., Levine, M., Sene, M., Mallet, L., Lanthier, L., Payette, L., Rodrigue, MC., Brazeau, S. (2016). Knowledge translation strategy to reduce the use potentially inappropriate medications in elderly inpatients. Journal of the American Geriatrics Society 64 (12), 2487–2494. DOI. (Published).
  • Brendan C. Delaney, Vasa Curcin, A. Andre?asson, Theodoros N. Arvanitis, Hilde Bastiens, Derek Corrigan, Jean-Francois Ethier, Olga Kostopoulou, Wolfgang Kuchinke, Mark McGilchrist, Paul van Royen, Peter Wagner. (2015). Translational Medicine and Patient Safety in Europe:TRANSFoRm. Architecture for the Learning Health System in Europe. BioMed Research International 2015 1-8. DOI. (Published).
  • J.-F. Ethier, V. Curcin, A. Barton, M. M. McGilchrist, H. Bastiaens, A. Andreasson, J. Rossiter, L. Zhao, T. N. Arvanitis, A. Taweel, B. C. Delaney, A. Burgun. (2014). Clinical Data Integration Model: Core Interoperability Ontology for Research Using Primary Care Data. Methods of Information in Medicine 54 (1), 16-23. (Published).
  • Ethier JF, Dameron O, Curcin V, McGilchrist MM, Verheij RA, Arvanitis TN, Taweel A, Delaney BC, Burgun A. (2013). A unified structural/terminological interoperability framework based on LexEVS: application to TRANSFoRm. Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA 20 (5), 986-994. (Published).
  • Charles St-Arnaud, Jean-François Éthier, Cindy Hamielec, Andrew Bersten, Gordon Guyatt, Maureen Meade, Qi Zhou, Marc-André Leclair, Alpesh Patel, François Lamontagne. (2013). Prescribed targets for titration of vasopressors in septic shock: a retrospective cohort study. CMAJ Open 1 (4), E127-E133. (Published).

Ressources en ligne

  • Jean-François Ethier Adrien Barton Paul Fabry. (2019). Clinical Laboratory Test Document Ontology (LABO). Site Web.
  • (2019). VIDEO : Consentir à l’utilisation de ses données de santé en recherche // Giving Consent to the Use of One's Health Data in Research. Site Web.
  • (2019). VIDEO : Réaliser de la recherche au moyen de données de santé // Conducting Research Using Health Data. Site Web.
  • JF Ethier, R Taseen, A Barton. (2016). Modèle Ontologique des Prescriptions Informatisées du Québec (MOPIQ). Site Web.
  • JF Ethier, A Barton, R Taseen. (2016). Prescription Drug Ontology (PDRO). Site Web.
  • A Barton, JF Ethier, R Duvauferrier, A Burgun. (2015). Bayesian Indicator of Performance Ontology (BIPO). Site Web.
  • A Barton, A Rosier, A Burgun, JF Ethier. (2014). Cardio-vascular disease ontology (CVDO). Site Web.
  • JF Ethier, A Barton, MM McGilchrist, A Burgun. (2014). Clinical Data Integration Model (CDIM) ontology. Site Web.

Articles de conférence

  • Barton, Adrien Tarbouriech, Cédric Vieu, Laure Ethier, Jean-François. (2022). A Mereological System for Informational Templates. CEUR Workshop Proceedings, (Published).
  • Fabry, Paul Goyer, François Barton, Adrien Ethier, Jean-François. (2022). An informational perspective on the ontology of services. CEUR Workshop Proceedings, (Published).
  • Toyoshima, Fumiaki Barton, Adrien Ethier, Jean-François. (2022). Investigating Functions in BFO from the Viewpoint of Extrinsic Dispositions. CEUR Workshop Proceeding, (Published).
  • Barton, A., Fabry, P., Ethier, J-F. (2020). A classification of instructions in drug prescriptions and pharmacist documents. 10th International Conference on Biomedical Ontology (ICBO 2019). (Published).
  • Fabry, P., Barton, A. Ethier, J-F. (2020). An Ontological Representation of Sex and Gender Information. 11th International Conference on Biomedical Ontologies (ICBO 2020). (In Press).
  • Barton, A., Toyoshima, F., Ethier, J-F. (2020). Approaching Roles with Affordances. FOUST : foundational ontologies : Joint Ontology Workshop. (In Press).
  • Barton, A., Toyoshima, F., Ethier, J-F. (2020). Clinical Documents and Their Parts. 11th International Conference on Biomedical Ontologies (ICBO 2020). (In Press).
  • Toyoshima, F. Barton, A., Ethier, J-F. (2020). Functional Parthood: A Dispositional Perspective. FOUST : foundational ontologies - Joint ontology Workshop. (In Press).
  • Fabry, P., Barton, A., Ethier, J-F. (2020). QUESTO – An ontology for questionnaires. 11th International Conference on Biomedical Ontologies (ICBO 2020). (In Press).
  • Ecarot, T., Fraikin, B., Ouellet, F., Lavoie, L., McGilchrist, M., Ethier, J-F. (2020). Sensitive Data Exchange Protocol Suite for Healthcare. IEEE Symposium on Computers and Communications. (In Press).
  • Barton, A., Toyoshima, F., Vieu, L., Fabry, P., Ethier, J-F. (2020). The Mereological Structure of Informational Entities. Formal Ontologies in Information Systems 2020. (In Press).
  • Corrigan, D., Curcin, V., Ethier, J-F., Flynn,A., Sottara,D. (2019). Computable Biomedical Knowledge objects : Expanded role and composition challenges. AMIA Annual summit. (Published).
  • Barton, A. Vieu, L., Ethier, J-F. (2019). Directing Actions. FOUST : foundational ontologies : Joint Ontology Workshop. (Published).
  • Barton, A., Fabry, P., Lavoie, L., Ethier, J-F. (2019). LABO: An ontology for laboratory test prescription and reporting. Ontology : Data in life sciences. (Published).
  • Barton, A., Jensen, L., Ethier, J-F. (2018). A taxonomy of disposition-parthood. Proceedings of the Joint Ontology Workshops 2017, CEUR Workshop proceedings, (Published).
  • Barton A., Cumin A., Jalbert R., Dault R., Ethier J-F. (2018). Consent to secondary use of clinical data for research purposes in a LHS: A scoping review. 2nd Ethical, Legal and Social Implications of Learning Health Systems symposium. (Published).
  • Barton, A., Duncan, W., Toyoshima, F., Ethier, J-F. (2018). First steps towards an ontology of belief. The Joint Ontology Workshops JOWO 2018. (Published).
  • Barton, A., Grenier, O., Ethier, J-F. (2018). The identity and mereology of pathological dispositions. Proceedings of the 9th International Conference on Biological Ontology (ICBO 2018), (Published).
  • Barton, A. Grenier, O., Jensen, L., Ethier, J-F. (2018). The identity of dispositions. Formal Ontology in Information Systems. Proceedings of the 10th International Conference (FOIS 2018), (Published).
  • Barton A, Khnaisser C, Lavoie L, Ethier J-F. (2017). Ambiguities in medical bitemporalized relational databases: a referent tracking view. Ontologies and Data in Life Sciences. (Published).
  • Barton A, Jansen L, Ethier J-F. (2017). A taxonomy of disposition-parthood. Workshop on Foundational Ontology. (Published).
  • Benoit Cossette, Jean-François Éthier, Thomas Joly-Mischlich, Josée Bergeron, Geneviève Ricard, Serge Brazeau, Mathieu Caron, Olivier Germain, Hélène Payette, Janusz Kaczorowski, Mitchell Levine. (2017). Reduction in potentially inappropriate medication use in elderly inpatients: a pragmatic randomized controlled trial. Annual Scientific Meeting of the American Geriatrics Society. (Published).
  • Khnaisser C, Lavoie L, Ethier J-F. (2017). Unified Bitemporal Modelling Framework for Automatic Data Warehouse Design. 28th International Conference on Database and Expert Systems Applications - DEXA 2017. (Published).
  • Adrien Barton Ludger Jansen, Arnaud Rosier and Jean-François Ethier. (2017). What is a risk? A formal representation of risk of stroke for people with atrial fibrillation. International Conference on Biomedical Ontology 2017. (Published).
  • Shao F. Liang, Talya Porat, Archana Tapuria, Jean-François Ethier, Brendan C. Delaney, Vasa Curcin. (2016). A Dynamic Medical Terminology Mapping System – MeTMapS. Data Mining for Medical Informatics: Learning Health. (Published).
  • Beaulieu MD, Boivin A, Dumez V, Ethier J-F, Kaczorowski J, Légaré F, Pluye P, Rhame E, Vanasse A, Bush PL, Cloutier AM, Fournier M, Gordie B, Zomahoun H. (2016). Implementing infrastructure for primary care patient oriented research: Challenges and opportunities. Family Medicine Forum. (Published).
  • Ethier J-F, Taseen R., Lavoie L., Barton A. (2016). Improving the Semantics of Drug Prescriptions with a Realist Ontology. Proceedings of the Joint International Conference on Biological Ontology and BioCreative (2016), CEUR-ws.org 1747. (Published).
  • SF Liang, J-F Ethier, T Porat, A Tapuria, BC. Delaney, V Curcin. (2016). MeTMapS – Medical Terminology Mapping System. Proceedings of the 7th Workshop on Ontologies and Data in Life Sciences, (Published).
  • Barton A., Taseen R., Ethier JF. (2016). On Prescribing Drug Prescriptions. Vaccine and Drug Ontology studies (VDOS-2016). (Published).
  • Barton A, Ethier J-F, Taseen R. (2016). Ontologies to support Learning Health Systems. Clinical Terminology Shock & Awe, 5th Annual Workshop of the Clinical and Translational Science Ontology Group. (Published).
  • Barton A., Ethier JF. (2016). The two ontological faces of velocity. Proceedings of the 9th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS 2016, Netherlands, 123-136. (Published).
  • Khnaisser Christina, Lavoie Luc, Diab Hassan, Ethier Jean-François. (2015). Data Warehouse Design Methods Review: Trends, Challenges and Future Directions for the Healthcare Domain. proceedings of ADBIS 2015 with Communications in Computer and Information Science, (Published).
  • Lei Zhao, Sarah N. Lim Choi Keung, Christopher Golby, Jean-François Ethier, Vasa Curcin, Hilde Bastiaens, Anita Burgun, PhD2, Brendan C. Delaney, Theodoros N. Arvanitis. (2015). EU FP7 TRANSFoRm Project: Query Workbench for Participant Identification and Data Extraction. AMIA CRI 2015. (Published).
  • Sarah N. Lim Choi Keung, Lei Zhao, Jean-François Ethier, Vasa Curcin, Anita Burgun, Brendan C. Delaney, Theodoros N. Arvanitis. (2015). Semantic Enrichment of CDISC Operational Data Model. AMIA CRI 2015. (Published).
  • Sarah N. Lim Choi Keung, Lei Zhao, Theodoros N. Arvanitis, Vasa Curcin, Brendan Delaney, Jean-François Ethier, Anita Burgun, Mark McGilchrist, Piotr Bródka ,Anna Andreasson. (2015). TRANSFoRm: Implementing a Learning Healthcare System in Europe through Embedding Clinical Research into Clinical Practice. Hawaii International Conference on System Sciences. (Published).
  • Mark McGilchrist, Vasa Curcin, Jean-Francois Ethier, Theodoros Arvanitis, Brendan Delaney. (2015). TRANSFoRm connectivity infrastructure to embed eCRFs into EHR systems. AMIA CRI 2015. (Published).
  • Sarah N. Lim Choi Keung, Lei Zhao,James Rossiter, Mark McGilchrist, Frank Culross, Jean-François Ethier, Anita Burgun, Robert A. Verheij, Nasra Khan, Adel Taweel, Vasa Curcin, Brendan C. Delaney, Theodoros N. Arvanitis. (2014). Detailed Clinical Modelling Approach to Data Extraction from Heterogeneous Data Sources for Clinical Research. 2014 AMIA Clinical Research Informatics Summit. (Published).
  • Curcin V, Arvanitis TN, Ethier J-F, Fraczkowsk K, Kazienko P, Brodka P, Andreasson A, Blizniuk G, Lim Choi Keung SN, Zhao L, Misiaszek A, McGilchrist M, Delaney B, Burgun A. (2014). Semantic approach to achieving interoperability between clinical care and clinical research. New Routes for General Practice and Family Medicine - The 19th WONCA Europe Conference. (Published).
  • A. Barton, A.Rosier, A. Burgun, JF. Ethier. (2014). The Cardiovascular Disease Ontology. Proceedings of the eighth conference (FOIS 2014), 409-414. (Published).
  • S.N. Lim Choi Keung, J.-F. Ethier, L. Zhao, V. Curcin, T.N. Arvanitis. (2014). The Integration Challenges in Bridging Patient Care and Clinical Research in a Learning Healthcare System. European Medical Informatics Conference 2014. (Published).
  • Delaney BC, Ethier J-F, Curcin V, Corrigan D, Friedman C. (2013). International perspectives on the digital infrastructure for The Learning Healthcare System. Panel at AMIA annual symposium. (Published).
  • Sarah N. Lim Choi Keung, Lei Zhao, James Rossiter, Ire Ogunsina, Vasa Curcin, Roxana Danger, Mark McGilchrist, Jean-François Ethier, Christian Ohmann, Wolfgang Kuchinke, Adel Taweel, Brendan C. Delaney, Theodoros N. Arvanitis. (2013). Provenance-aware Query Formulation Tool to Identify Eligible Clinical Research Participants. AMIA Clinical Research Informatics Summit. (Published).
  • Delaney BC, Ethier J-F, Taweel A, Arvanitis TN. (2012). Semantic Interoperability for Clinical Research in Europe. AMIA Summit on Clinical Reserach Informatics. (Published).
  • C. St-Arnaud, J.F. Éthier, C. Hamielec, M.A. Leclair, F. Lamontagne. (2011). Prescribed targets for vasopressor titration in septic shock: a retrospective cohort study. European Society of Intensive Care Medicine. (Published).

Autres contributions

Cours enseignés

  • Apprentissage du raisonnement clinique // Learning Clinical Reasoning. (2013-01-01).
  • Professional development and financial affairs.

Gestion d'évènements

  • Local chair. (2023) 13th International Conference on Formal Ontology in Information Systems (FOIS 2023). (Conference).
  • Organisateur principal. (2021) Séminaire systèmes de santé apprenant (ACFAS). (Conference).
  • Membre du comité organisateur. (2018) Symposium sur l'accès aux données et les systèmes de santé apprenant. (Conference).

Activités de collaboration internationale

  • Researcher. United Kingdom. Development of MetMaps, an application facilitating terminology mappings so various sources coded with different terminologies can be used seamlessly (E.g. ICD 10 in Canada and Read Codes 2 in the UK).

Présentations

  • (2019). Computable Biomedical Knowledge Objects: Expanded role and composition challenges - Phenotype as a use-case. American Medical Informatics Association annual symposium. Washington, DC, United States of America
  • (2019). Implementation of a province-wide ecosystem to maximise health data value for all: challenges and solutions. Academic Health Sciences Network seminar. Vancouver, Canada
  • (2019). PARS3, an infrastructure to support data access activities in context of learning health systems. McGill's Seminar Series in Quantitative Life Sciences and Medicine Sponsored by CAMBAM, QLS, MiCM and the Ludmer Centre. Montréal, Canada
  • (2019). Partage des données de santé au Québec: Permettons de changer le devenir des patients avec PARS3. Comité OPQ-CMQ. Montréal, Canada
  • (2019). Partage des données de santé au Québec : Les systèmes de santé apprenant au service des citoyens. Conférence "En mode senior". Anger, France
  • (2019). Plateforme Apprenante pour la recherche en santé et services sociaux. Journée scientifique ODIM : Ontologie, Données et Informatique Médicale. Toulouse, France
  • (2019). Évaluer et améliorer la qualité des soins - Soutenir le suivi de personnes diabétiques en première ligne. Symposium CQMF sur les innovations en santé. Montréal, Canada
  • (2018). A learning Health and Social Services Research Platform to support sustainable research. Drug Information Association annual symposium. Boston, United States of America
  • (2018). Données de recherche en contexte d'utilisation secondaire des données en santé. 35e colloque de l'ADARUQ. Orford, Canada
  • (2018). Learning Health Systems: experience and future in primary care. The System Awakens: Building Learning Healthcare Systems in Canada. Vancouver, Canada
  • (2018). Quelles ontologies pour un système de santé apprenant. Symposium annuel de la Société de philosophie des sciences. Nantes, France
  • (2018). Utilisation des données cliniques issues des dossiers médicaux électroniques à des fins de recherche et d’amélioration continue de la qualité des soins et services de première ligne. Colloque Informatique Santé (SOQUIBS). Drummondville, Canada
  • (2017). Développement d’un système de santé apprenant en Estrie. Sherbio. Sherbrooke, Canada
  • (2017). La plateforme de recherche apprenante en santé de l'Estrie : libérer le potentiel de nos données pour la recherche. Centre de recherche du CHUS. Sherbrooke, Canada
  • (2017). La recherche à partir des dossiers médicaux électroniques (DMÉ) dans un système de santé apprenant?: défis et opportunités. 8e Journée d'étude des comités d'éthique de la recherche et de leurs partenaires. Canada
  • (2017). Système de recherche apprenant : Changement de paradigme et opportunités. INSERM UMRS 1138. Paris, France
  • (2017). Système de recherche apprenant : défis éthiques. Comité d’éthique pour la recherche, CIUSSS de l’Estrie – CHUS. Sherbrooke, Canada
  • (2016). Accès et partage des données des DMÉs au Québec : Vision, orientations, innovation. Journée de la recherche, département de médecine familiale, Université de Sherbrooke. Sherbrooke, Canada
  • (2016). Learning Health Systems - New avenues. Farr Primary Care Conference. Swansea, United Kingdom
  • (2016). Les systèmes de santé apprenant : la recherche translationnelle sous l’angle des données de santé pragmatiques provenant du terrain. Webinaire, Réseau 1 Québec. Canada
  • Rémi Quirion, Louis-Martin Rousseau, Jean-François Plante, Jean-François Ethier. (2016). À la recherche du patient au cœur des données massives // Looking for the patient at the core of big data. Déjeuner du scientifique en chef du Québec à l'Assemblée Nationale. Présentation aux députés. Québec, Canada
  • (2015). Learning Health System – LHS : La recherche translationnelle sous l’angle des données de santé pragmatiques provenant du terrain. Faculté de Pharmacie – Séminaire de l’axe Médicaments et santé des populations, Université de Montréal. Montréal, Canada
  • (2015). Les données de santé: comment les utiliser efficacement pour améliorer votre pratique, votre recherche. Journée scientifique 2015 des innovations en soins de première ligne au Québec. Montreal, Canada
  • (2015). Les systèmes de santé apprenant : la recherche translationnelle sous l’angle des données de santé pragmatiques provenant du terrain. Conférence magistrale du département de médecine, Université de Sherbrooke. Sherbrooke, Canada
  • (2014). Savoir c'est pouvoir: les données en santé. Conférence magistrale du département de médecine du centre hospitalier de l'Université de Montréal. Montréal, Canada
  • Brendan C Delaney MD, Jean-Francois Ethier, MD MSc, Vasa Curcin PhD, Derek Corrigan MSc, Charles Friedman PhD. (2013). International perspectives on the digital infrastructure for The Learning Healthcare System. American Medical Informatics Association Annual Symposium. Washington DC, United States of America