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Sébastien Roy

Professeur, Faculté des sciences
FAC. SCIENCES Biologie

Présentation

Sujet de recherche

Micro-organismes, Comportement biologique

Disciplines de recherche

Biologie et autres sciences connexes

Mots-clés

Écoréhabilitation, Génétique de Frankia sp, Microbiolo environ., Revégétalisation, Symbiose actinorhizienne

Intérêts de recherche

Ma recherche se situe à l'interface de la recherche fondamentale et appliquée. Je développe des stratégies de revégétalisation de sites miniers à l'aide de plantes pionnières symbiotiques, tout en étudiant l'impact de l'activité humaine sur ces associations plantes-microorganismes. Les stress anthropogéniques d'intérêt sont les sels, métaux lourds, hydrocarbures aliphatiques et aromatiques, pH. Mes recherches appliquées sont soutenues par une recherche fondamentale regroupant la phylogénétique, les manipulations génétiques, ainsi que l'étude du cycle de vie de l'actinobactérie fixatrice d'azote Frankia sp.

Centre de recherche

Aucun

Langues parlées et écrites

Anglais, Français

Diplômes

(2003). (Postdoctorat, Environmental microbiology). Biotechnology Res Inst.

(2000). (Doctorat, Biology (microbiology)). Université de Sherbrooke.

(1996). (Maîtrise avec mémoire, Biology (microbiology)). Université de Sherbrooke.

(1994). (Baccalauréat, Biology (microbiology)). Université de Sherbrooke.

Expérience académique

Professor. (2016-). Université de Sherbrooke. Canada.

Associate Professor. (2011-2016). Université de Sherbrooke. Canada.

Assistant professor. (2006-2011). Université de Sherbrooke. Canada.

Research assistant. (1998-2000). Université de Sherbrooke. Canada.

Research assistant. (1998-2000). Université de Sherbrooke. Canada.

Prix et distinctions

  • (2000) Mention of excellence for thesis defence. Université de Sherbrooke. (Distinction).
  • Grande distinction en enseignement universitaire – volet équipe. Centre SÈVE, Université de Sherbrooke. 27 février 2018. Université de Sherbrooke. (Prix).

Financement

  • Subvention. (Obtenu). Chercheur principal. Alder-microbe interactions and adaptations in changing environments.. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et Génie du Canada (CRSNG). Discovery Grant- individual. 140 000 $. (2019-2024)
  • Subvention. (Obtenu). Chercheur principal. Étude des végétaux rustiques de la Fosse du Labrador pour adresser l'érosion éolienne et établir un couvert végétal sur les parcs à résidus nordiques. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Projets de recherche orientée en partenariat / Développement durable du secteur minier - II. 300 000 $. (2021-2024)
  • Subvention. (En cours d’évaluation). Cochercheur. Évaluation de la migration des métaux et métalloïdes dans l'environnement immédiat de dépôts de résidus miniers et validation de techniques analytiques portables pour accélérer l'évaluation des risques. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Projets de recherche orientée en partenariat / Développement durable du secteur minier - II. 300 000 $. (2021-2024)
  • Subvention. (Obtenu). Cocandidat. Centre SÈVE – regroupement stratégique. Fonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies (FQRNT). Regroupements stratégiques.. 2 880 000 $. (2017-2023)
  • Subvention. (Obtenu). Chercheur principal. Développement d'une approche intégrative de restauration minière valorisant le patrimoine vivant duTerritoire Eeyou Istchee. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Projets de recherche orientée en partenariat / Développement durable du secteur minier - II. 300 000 $. (2020-2023)
  • Subvention. (Obtenu). Cochercheur. Acquisition of a focused-ultrasonicator system. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et Génie du Canada (CRSNG). Research Tools and Instruments. 124 105 $. (2021-2022)
  • Subvention. (En cours d’évaluation). Cochercheur. Acquisition of a gas chromatographer (GC) equipped with a headspace autosampler. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et Génie du Canada (CRSNG). Outils et instruments de recherche (OIR). 72 380 $. (2021-2022)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Identifying species and planting conditions to revegetate mixed mine tailings at the Whabouchi site operated by Nemaska Lithium in Northern Québec.. MITACS. MITACS Accelerate. 30 000 $. (2019-2020)
  • Subvention. (Obtenu). Cocandidat. Accelerating innovations to adapt agro-environments to climate change: The Eastern Canadian Plant Phenotyping Platform. Canada Foundation for Innovation (CFI). Innovation Fund 2017. 23 798 545 $. (2017-2019)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Afforestation/reforestation for the sustainable mineland reclamation and greenhouse gas management in the Canadian mining sector. (2016-2019)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Développement d'une approche durable de restauration progressive d'extrants miniers mixtes (stériles et résidus) des nouvelles mines du Nord Québécois; les espèces végétales indigènes à la rencontre des besoins des communautés cries.. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Programme de recherche en partenariat sur le développement durable du secteur minier. 299 969 $. (2016-2019)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Appui salarial à un poste de professionnelle de recherche. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Appui salarial à un poste de professionnelle de recherche. 16 500 $. (2017-2018)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Développement de techniques de réhabilitation écologique prédictives: étude de la sélection naturelle d'arbres et herbacées (sur 50 ans) sur un dépôt de résidus acidogènes.. (2015-2018)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Vehicles and mobile laboratory for field research in ecology. Conseil de Recherches en Sciences Naturelles et Génie du Canada (CRSNG). Outils et instruments de recherche. 110 651 $. (2017-2018)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Land capitalization through the use of indigenous woody species from Southern Québec.. CRSNG & CRSH. Engage. 24 916 $. (2017-2017)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Adaptation of Frankia, alders, and their symbiosis to environmental stress.. (2012-2017)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Centre SÈVE : Centre de recherche en sciences du végétal. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Regroupements stratégiques. 809 600 $. (2015-2017)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. La revégétalisation comme outil d'intervention et rétablissement des services écosystémiques sur les sites miniers non-acidogènes. (2014-2017)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Prédictions critiques en revégétalisation de résidus acidogènes:effet des symbioses plantes-microorganismes sur la translocation des métaux et mécanismes assurant le maintien de l'homéostasie chez l'aulne dans ces environnements. (2014-2017)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Acquisition of a Fluorescence-Activated Cell Sorter (FACS). (2015-2016)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Développement de technologies de revégétalisation de haldes et résidus miniers acidogènes:exploitation de plantes symbiotiques et de biomasse industrielle résiduelle.. (2013-2015)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Heavy metal filtration by vegetation on gold mine tailings: prediction and testing using naturally-occuring and introduced vegetation. (2015-2015)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Centre SÈVE : Centre de recherche en sciences du végétal. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Regroupements stratégiques. 450 000 $. (2012-2015)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Unlocking the biotechnological potential of Frankia: reclaiming Canada's mine waste-affected lands using symbiotic alders. (2012-2015)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Caractérisation et culture axénique d'un mycète truffier indigène du Québec. (2013-2014)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Établissement et évaluation de la symbiose actinorhizienne chez l'aulne produit en serre industrielle. (2013-2014)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Développement de techniques permettant l'étude génétique de Frankia sp.. (2012-2014)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Échanges génétiques chez Frankia en présence de stress environnemental: une étude sur les éléments intégratifs et conjugatifs (ICE).. (2011-2014)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Purchase of an multi-elemental analyser to support applied and fundamental research in plant and soil ecology / Analyseur multi-élémentaire pour la recherche en écologie des plantes et du sol.. (2013-2014)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Réduction concomittante des gaz à effet de serre et d'odeurs provenant d'un lieu d'enfouissement sanitaire par des biorecouvrements.. (2011-2013)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Filtration biologique pour la réduction des éléments traces contaminants dans la biomasse des arbres.. (2010-2013)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Centre d'étude et de valorisation de la diversité microbienne. (2011-2012)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Acquisition d'une ultracentrifugeuse. (2011-2012)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Centre SÈVE : Centre de recherche en sciences du végétal. Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies (FRQNT). Regroupements stratégiques. 1 518 000 $. (2011-2012)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Développement de techniques permettant la manipulation génétique de Frankia sp.. (2010-2012)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Purchase of growth chambers for studying micronutrient dynamics at the soil-plant interface.. (2011-2012)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Study of the impact of anthropogenic stress on Frankia sp., alders, and their symbiosis. Étude de l'impact du stress anthropogénique sur Frankia sp., les aulnes et leur symbiose. (2007-2012)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Sustainable management of oil sands tailings using actinorhizal alder technology: large-scale field trials involving global impact studies and the optimization/expansion of existing operational parameters.. (2008-2012)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Système d'imagerie digitale.. (2011-2012)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Automated instrument for timecourse metabolic studies of bacteria. Système automatisé pour l'étude dynamique du métabolisme bactérien.. (2010-2011)
  • Subvention. (Terminé). Cocandidat. Centre d'étude et de valorisation de la diversité microbienne. (2006-2011)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Actinomycorrhizal alder technology development for the rehabilitation of disturbed ecosystems in the oil sands industry of Alberta.. (2009-2010)
  • Subvention. (Terminé). Chercheur principal. Développement de techniques permettant la manipulation génétique de Frankia sp.. (2008-2010)
  • Subvention. (Terminé). Candidat principal. Transcriptomic study of the cellular differentiation in Frankia sp. (reproductive torulose hyphae). (2009-2010)

Publications

Articles de revue

  • Garneau, L*; Beauregard, PB; Roy, S. (2022). FrankiaDeciphering the role of non- nodular endophytes in alder through and genomic characterization. Canadian Journal of Microbiology (Article accepté).
  • Garneau, L*; Beauregard, PB; Roy, S. (2022). FrankiaNeighbours in nodules: the interactions between sp. ACN10a and non-nodular endophytes of alder. Canadian Journal of Microbiology (Article accepté).
  • Mohr, JF*; Gama, S*; Roy, S; Bellenger, JP; Plass, W*; Wichard, T. (2022). Hydroxypiridinones in nitrogen-fixing bacterial cultures: a a metal buffer formolybdenum and simulation of natural conditions. Metallomics 14 (8), mfac055. (Article publié).
  • Rizzi A*, Leroux J, Charron-Lamoureux V, Roy S, Beauregard PB, Bellenger J-P. (2020). Bacillus subtilis modulates its usage of biofilm-bound iron in response to environmental iron availability. Applied and Environmental Microbiology 86 (22), e00944-20. (Article publié).
  • Gagnon V*, Rodrigue-Morin M*, Tardif A*, Beaudin J, Greer CW, Shipley B, Bellenger J-P, Roy S. (2020). Differences in elemental composition of tailings, soils, and plant tissues following five decades of native plant colonization on a gold mine site in Northwestern Quebec. Chemosphere 250 126243. (Article publié).
  • Mohr JF*, Weissa A, Roy S, Wichard T. (2020). FrankiaDraft Genome Sequence of sp. Strain CH37, a Metallophore Producing, Nitrogen-Fixing, Actinobacterium isolated from the sea buckthorn(Elaeagnaceae). Microbiology Resource Announcements 9 (50), (Article publié).
  • Mohr, JF*; Weiss, A; Roy, S; Wichard, T. (2020). FrankiaGenome sequence of sp. strainCH37, a metallophore-producing, nitrogenfixing actinobacterium isolated from the seabuckthorn, (Elaeagnaceae). Microbiology Resource Announcements 9 (50), e01184-20. (Article publié).
  • Rodrigue-Morin M*, Gagnon V*, Roy S, Bellenger J-P. (2020). FrankiaMeasuring the plasticity of alders, spp. and the actinorhizal symbiosis following exposure to acid mine drainage. Ecological Engineering
  • Gagnon V*, Rodrigue-Morin M*, Tremblay J, Wasserscheid J, Champagne J, Bellenger J-P, Greer CW, Roy S. (2020). Life in mine tailings: microbial population structure across the bulk soil, rhizosphere and roots of boreal species colonizing mine tailings in northwestern Québec. Annals of Microbiology (Article publié).
  • Gagnon V*, Rodrigue-Morin M*, Migneault M, Tardif A*, Garneau L*, Lalonde S*, Shipley B, Greer CW, Bellenger J-P, Roy S. (2020). Survival, growth and element translocation by 4 plant species growing on acidogenic gold mine tailings inQuébec. Ecological Engineering 151 105855. (Article publié).
  • Gagnon V*, Rodrigue-Morin M*, Tremblay J, Wasserscheid J, Champagne J, Bellenger J-P, Greer CW, Roy S. (2020). Vegetation drives the structure of active microbial communities on an acidogenic mine tailings deposit. Peer Journal 8 e10109. (Article publié).
  • Lalancette S*, Lerat S, Roy S, Beaulieu C. (2019). Alnus incanaFungal endophytes of subsp. and subsp. and their potential to tolerate heavy metals and to promote plant growth. Mycobiology 47 (4), 415-429. (Article publié).
  • Rizzi A*, Roy S, Bellenger J-P, Beauregard PB. (2019). Bacillus subtilisIron homeostasis in requires siderophore production and biofilm formation. Applied and Environmental Microbiology 85 (3), e02439-18. (Article publié).
  • Tardif A*, Rodrigue-Morin M*, Gagnon V*, Shipley B, Roy S, Bellenger J-P. (2019). The relative importance of abiotic conditions and subsequent land use on the boreal primary succession of acidogenic mine tailings. Ecological Engineering 127 66-74. (Article publié).
  • Rodrigue-Morin M*, Gagnon V*, Roy S, Bellenger J-P. (2018). Alnus incana ssp. rugosaMorphometric and elemental changes in actinorhizal alder shrub seedlings; the cases of and ssp. crispa. Ecological Engineering
  • Barrette K*, Darnajoux R*, Rodrigue-Morin M*, Bellenger J-P, Roy S. (2018). Impacts of heavy metals from gold mine tailing sands on the actinorhizal symbiosis in alder shrubs - Evaluating the risk of metal dispersion during leaf fall. Chemosphere
  • Deicke M*, Mohr JF*, Roy S, Herzsprung P, Bellenger J-P, Wichard T. (2018). Metallophore profiling of nitrogen-fixing Frankia spp. to understand metal management in the rhizosphere of actinorhizal plants. Metallomics 11 (4), 810-821. (Article publié).
  • Callender KL, Roy S, Khasa D, Whyte L, Greer, CW. (2016). Actinorhizal alder phytostabilization alters microbial community dynamics in gold mine waste rock from Northern Quebec: A greenhouse study. PLoS One 11 (2), e0150181. (Article publié).
  • Beaudoin-Nadeau M, Gagné A, Bissonnette C*, Bélanger P-A*, Fortin JA, Roy S, Greer C, Khasa D. (2016). Performance of ectomycorrhizal alders exposed to Canadian oil sands tailing stressors under in vivo bipartite symbiotic conditions. Canadian Journal of Microbiology 62 (7), 543-549. (Article publié).
  • Pourhassan N*, Bruno S, Jewell MD, Shipley B, Roy S, Bellenger J-P. (2016). Phosphorus and micronutrient dynamics during gymnosperm and angiosperm litters decomposition in temperate cold forest from Eastern Canada. Geoderma 273 25-31. (Article publié).
  • Allard N*, Garneau D, Poulin-Laprade D*, Brzezinski R, Burrus V, Roy S. (2015). Escherichia coliA diaminopimelic acid auxotrophic donor provides improved counterselection following intergeneric conjugation with actinomycetes. Canadian journal of Microbiology 61 (8), 565-574. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Bellenger J-P, Roy S. (2015). Heavy metal stress in alders: Tolerance and vulnerability of the actinorhizal symbiosis. Chemosphere 138 300-308. (Article publié).
  • Pourhassan N*,Wichard T, Roy S, Bellenger J-P. (2015). Impact of elevated CO2 on metal homeostasis and the actinorhizal symbiosis in early successional alder shrubs. Environmental and Experimental Botany 109 168-176. (Article publié).
  • Khasa DP, Nadeau MB, Roy S, Greer CW. (2014). Phytobial remediation of Sigma-Lamaque gold mine waste lands in Val D'Or, Québec. Canadian Reclamation 14 (1), 36-39. (Article publié).
  • Bissonnette C*, Fahlman B, Peru K, Khasa DP, Greer CW, Headley JV, Roy S. (2014). Symbiosis with Frankia sp. benefits the establishment of Alnus viridis ssp. crispa and Alnus incana ssp. rugosa in tailing sands from the Canadian oil sands industry. Ecological Engineering 68 167-175. (Article publié).
  • Mallet P-L*, Roy S. (2014). The symbiosis between Frankia alni and alder shrubs results in a tolerance of the environmental stress associated with tailings from the Canadian Oil Sands Industry. Journal of Petroleum and Environmental Biotechnology 5 (3), 1-9. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Bellenger J-P, Roy S. (2013). Strong modulation of nutrient distribution in Alnus glutinosa as a function of the actinorhizal symbiosis. Botany 91 (4), 218-224. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Bissonnette C*, Bernèche-D'Amours A*, Bellenger J-P, Roy S. (2011). Assessing the adaptability of the actinorhizal symbiosis in the face of environmental change. Environmental and Experimental Botany 74 98-105. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Beaudin J*, Roy S. (2011). High-Throughput screening of microbial adaptation to environmental stress. Journal of Microbiological Methods 85 92-97. (Article publié).
  • Bernèche-D'Amours A*, Ghinet MG, Beaudin J*, Brzezinski R, Roy S. (2011). Sequence analysis of rpoB and rpoD gene fragments reveals the phylogenetic diversity of symbiotic actinobacteria of genus Frankia. Canadian Journal of Microbiology 57 (3), 244-249. (Article publié).
  • Ghinet MG, Bordeleau E, Beaudin J*, Brzezinski R, Roy S, Burrus V. (2011). Uncovering the Prevalence and Diversity of Integrating Conjugative Elements in Actinobacteria. PLoS One 6 e27846-e27846. (Article publié).
  • Ghinet MG, Roy S, Poulin-Laprade D*, Lacombe-Harvey M-È, Morosoli R, Brzezinski R. (2010). Chitosanase from Streptomyces coelicolor a3(2): biochemical properties and role in protection against antibacterial effect of chitosan. Biochemistry and Cell Biology 88 907-916. (Article publié).
  • Lefrançois E*, Quoreshi A, Khasa DP, Fung M, Whyte LG, Roy S, Greer C. (2010). Field performance of Alder-Frankia symbionts for the reclamation of oil sands sites. Applied Soil Ecology 46 183-191. (Article publié).
  • Quoreshi A, Roy S, Greer C, Beaudin J*, McCurdy J, Khasa DP. (2007). Inoculation of green alder (Alnus crispa) with Frankia-ectomycorrhizal fungal inoculant under commercial nursery production conditions. Native Plants Journal 8 (3), 271-281. (Article publié).
  • Roy S, Fortin M, Gagnon J, Ghinet MG, LeHoux J-G, Dupuis G, Brzezinski R. (2007). Quantitative fluorometric analysis of the protective effect of chitosan on thermal unfolding of catalytically active native and genetically-engineered chitosanases. Biochimica and Biophysica Acta- Proteins and proteomics 1774 (8), 975-984. (Article publié).
  • Roy S, Khasa, D.P., Greer, C.W. (2007). Review: Combining alders, frankiae, and mycorrhizae for soil remediation and revegetation. Canadian Journal of Botany 85 237-251. (Article publié).

Chapitres de livre

  • Beaulieu C, Simao-Beaunoir A-M, Roy S. (2009). Microbial traits associated with actinobacteria interacting with plants. Bouarab K, Brisson N, Daayf F. Molecular Plant-microbe interactions (288-318). CABI. (Article publié).

Articles de conférence

  • Alix-Paré O*, Garneau L*, Malo S*, Rochefort L, Bellenger J-P, Laforest-Lapointe I, Shipley B, Roy S. (2022). Acclimatation de plantes indigènes au territoire Eeyou Istchee pour la restauration minière. Québec Mines + Énergie 2022. (Article publié).
  • Garneau L*, Théau J, Roy S. (2022). Désert boréal: les facteurs limitants la revégétalisation naturelle du parc à résidus fins d'une ancienne mine de fer. Québec Mines + Énergie 2022. (Article publié).
  • Malo S*, Alix-Paré O*, Roy S, Laforest-Lapointe I, Rochefort L, Bellenger J-P. (2022). Les bryophytes, une solution à l'importante mortalité en revégétalisation de site minier?. Québec Mines + Énergie 2022. (Article publié).
  • Ishak, S*, Roy S, Laforest-Lapointe I. (2022). Of Microbiomes and Mosses: Exploring the functional diversity of the boreal mossmicrobiome from the Eeyou Istchee region of Québec. 15e Colloque du CEF (Centre d'étude de la forêt), 'Sols et mousses' session. (Article publié).
  • Ishak S*, Roy S, Laforest-Lapointe I. (2022). Of Microbiomes and Mosses: Exploring the functional diversity of the boreal mossmicrobiome from the Eeyou Istchee region of Québec. ESA-CSEE 2022 General Meeting, 'Moss Ecology in a Changing World',. (Article publié).
  • Ishak S*, Roy S, Laforest-Lapointe I. (2022). Of Microbiomes and Mosses: Exploring the functional diversity of the boreal mossmicrobiome from the Eeyou Istchee region of Québec. Canadian Botanical Association 2022 Annual Conference, 'When Maths meets Botany'. (Article publié).
  • Liu C*, Pouliot K, Rochefort L, Roy S. (2022). Pioneer moss regenerationfor mine waste rocks revegetation. Québec Mines + Énergie 2022. (Article publié).
  • Liu C*, Pouliot K, Rochefort L, Roy S. (2022). Pioneer moss regeneration for mine waste rocks revegetation. Sentinel North. (Article publié).
  • Liu C*, Pouliot K, Rochefort L, Roy S. (2022). Pioneer moss regenerationfor mine waste rocks revegetation. Science Symposium PERG & SER-EC. (Article publié).
  • Garneau L*, Lalonde S*, Beauregard PB, Roy S. (2019). Alder bacterial endophytes and their interactions: a symbiotic symphony. 69th annual conference of the Canadian Society of Microbiologists. (Article publié).
  • Lalonde S*, Roy S. (2019). Améliorer le pouvoir biofertilisant de la symbiose actinorhizienne en étudiant la composition du microbiome nodulaire. 40e Québec Mines + Énergie. (Article accepté).
  • Garneau L*, Lalonde S*, Beauregard PB, Roy S. (2019). Des arbustes robustes et leurs locataires racinaires : une conjugaison synergique pour la revégétalisation minière. 40e Québec Mines + Énergie. (Article accepté).
  • Chelo C*, Shipley JW et Roy S. (2019). L'utilisation des traits fonctionnels dans la sélection de végétaux indigènes pour la restauration progressive du site Whabouchi de Nemaska Lithium. 40e Québec Mines + Énergie. (Article accepté).
  • Lalonde S*, Roy S. (2019). MicromonosporaInvestigating the occurence of in nodules and rhizosphere of actinorhizal plants in Québec, Canada. 69th annual conference of the Canadian Society of Microbiologists. (Article publié).
  • Canton Ruz A*, Migneault M, Roy S et Shipley B. (2019). Utilisation de la phytométrie pour évaluer lafertilité des résidus miniers: une alternative offrant une réponse plus globaleet représentative que les analyses agronomiques conventionnelles. 40e Québec Mines + Énergie. (Article accepté).
  • Tardif A*, Cajolet-Boisclair H, Shipley B, Roy S. (2018). Importance des mycorhizes dans la revégétalisation naturelle d’un ancien site minier aurifère au Canada. Colloque international. 5èmes Journées Francophones des Mycorhizes. Université du Littoral Côte d’Opale. (Article accepté).
  • Garneau L*. (2018). Un nouveau système de culture végétale gnotobiotique en matrice transparente pour l’observation non destructive du système racinaire d’aulnes actinorhiziens. Les journées du Centre SÈVE. (Article publié).
  • Rizzi A*, Haroune L*, Roy S, Bellenger J-P, Beauregard PB. (2017). Biofilm and bacillibactin are essential to iron homeostasis in Bacillus subtilis. 19th International Conference on Bacillus and related Gram-positive bacteria. (Article publié).
  • Gagnon V*, Rodrigue-Morin M*, Greer CW, Roy S. (2017). Colonisation naturelle d'un site minier aurifère sur 50 ans: comparaison des populations microbiennes, de la structure élémentaire du sol et du potentiel de translocation de métaux lourds dans les plantes. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Roy S, Lalonde S*, Bélanger P-A, Garneau L*, Barrette K, Migneault M. (2017). Comment exploiter les principes de succession végétale et les associations microbiennes pour réussir sa réhabilitation minière à faible coût, sans amendement et sans préparation du site?. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Lalancette S*, Beaulieu C, Roy S. (2017). Isolement et sélection d’endophytes fongiques pour la phytostabilisation des métaux lourds dans le sol. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Garneau L*, Beauregard PB, Roy S. (2017). Le microbiome racinaire: un outil prometteur pour améliorer la performance des arbustes indigènes employés pour la réhabilitation minière au Québec Récipiendaire du prix: Prix (1ère place) du Défi de la recherche en géosciences de L'AQUEST. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Lalonde S*, Roy S. (2017). L’exploitation de microorganismes indigènes pour améliorer la survie et le développement de plantes pionnières lors de la réhabilitation de sites perturbés. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Gagnon V*, Greer CW, Roy S. (2017). Populations microbiennes des sols et composition élémentaire des végétaux colonisant un site minier aurifère depuis cinq décennies. Journées du Centre SÈVE. (Article accepté).
  • Rodrigue-Morin M*, Gagnon V*, Bellenger J-P, Roy S. (2017). Potentiel de translocation et de toxicité du drainage minier acide envers l'aulne, un arbuste de choix en restauration minière. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Lalonde S*, Roy S. (2017). Réponse à court terme de l’aulne par la co-inoculation de leurs endophytes. Journées du Centre SÈVE. (Article accepté).
  • Tardif A*, Shipley B, Chelo C*, Bellenger J-P, Roy S. (2017). Rétablissement autonome de la biodiversité boréale sur les sites miniers : l’importance relative des conditions du substrat et perturbations humaines. Québec Mines 2017. (Article accepté).
  • Greer CW, Callender K*, Tremblay J, Champagne J, Roy S, Bois G, Khasa DP. (2016). Applying genomics to monitor plant-microbe symbiosis during land reclamation at a gold mine. Canadian Institute of Mining, Metallurgy and Petroleum Conference. (Article publié).
  • Rizzi A*, Roy S, Beauregard PB, Bellenger J-P. (2016). Bacillus subtilisLe biofilm, un acteur essentiel de la gestion du fer chez. Journées du Centre Sève. (Article publié).
  • Rizzi A*, Roy S, Beauregard PB, Bellenger J-P. (2016). Bacillus subtilisLow intracellular iron concentration triggers biofilm formation. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME). (Article publié).
  • Gagnon V*, Roy S, Greer CW. (2016). Dynamique des populations microbiennes sous les arbres et arbustes ayant naturellement colonisé un site minier aurifère inactif depuis plusieurs décennies. Québec Mines 2016. (Article publié).
  • Lalonde S*, Garneau L*, Barrette K*, Migneault M, Roy S. (2016). La réhabilitation minière à faible coût et à faible empreinte de carbone; l’exploitation des principes de succession végétale et des associations plantes-microorganismes pour la revégétalisation sans amendement et sans préparation du site. Québec Mines 2016. (Article publié).
  • Gagnon V*, Roy S, Greer CW. (2016). Microbial ecology of native plants colonizing mine tailings. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME). (Article publié).
  • Garneau L*, Roy S. (2016). Neighbours in nodules: investigating microbial populations in alder root nodules and their plant growth-promotion potential. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME). (Article publié).
  • Rodrigue-Morin M*, Barrette K*, Roy S. (2016). Potentiel de translocation et de toxicité de résidus miniers acidogènes envers les espèces végétales et microbiennes indigènes. Québec Mines 2016. (Article publié).
  • Tardif A*, Shipley B, Roy S. (2016). Revégétalisation naturelle d’un site minier par les traits fonctionnels de plante. Colloque annuel du Centre de la Science de la Biodiversité du Québec (CSBQ). (Article publié).
  • Tardif A*, Shipley W, Roy S. (2016). Rétablissement autonome de la biodiversité boréale sur les sites miniers: une approche d'ingénierie inverse basée sur l’assemblage de traits fonctionnels. Québec Mines 2016. (Article publié).
  • Barrette K*, Darnajoux R, Bellenger J-P, Roy S. (2016). Symbionts under metal stress: microelemental management in actinorhizal alder exposed to mine tailings. 16th International Symposium on Microbial Ecology (ISME). (Article publié).
  • Garneau L*, Roy S. (2016). Vers la pleine exploitation du microbiome de nos arbustes indigènes pour optimiser leur développement sur les sites miniers les plus hostiles. Récipiendaire du prix : Prix (3ème place) du Défi de la recherche en géosciences de l'AQUEST. Québec Mines 2016. (Article publié).
  • Khasa DP, Greer CW, Quoreshi A, Gagné A, Aziez A*, Bulin S, Fortin JA, Callender K*, Juck D, Beaudin J, Bélanger P-A, Bissonnette C*, Roy S. (2015). Actinorhizal research in Québec (Canada) and applications in land reclamation of severely disturbed sites. 18th International Meeting on Frankia and Actinorhizal Plants. (Article publié).
  • Allard N*, Burrus V, Brzezinski R, Roy S. (2015). A diaminopimelic acid auxotrophic donor strain allows intergeneric conjugation with nalidixic acid-sensitive actinobacteria. 18th International Meeting on Frankia and Actinorhizal Plants. (Article publié).
  • Garneau L*, Bissonnette C*, Corbeil M-M*, Mallet P-L*, Beaudin J, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2015). Case studies in Alberta and Quebec reclamation sites: how low-cost nursery inoculants for pioneer shrubs reduce reclamation costs, accelerate CO2 capture, and derive nitrogen from thin air. 10th International Conference on Mine Closure. (Article publié).
  • Mohr F*, Deicke M*, Bélanger P-A, Bellenger J-P, Roy S, Wichard T. (2015). Metallophore screening in sp. using metal isotope coded profiling. 18th International Meeting on Frankia and Actinorhizal Plants. (Article publié).
  • Corbeil M-M*, Khasa D, Greer CW, Roy S. (2014). Actinorhizal and mycorrhizal symbioses in alder shrubs exposed to fine tailings from the gold mining industry. IUMS 2014 - Union internationale des sociétés de microbiologie 14th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 14th International congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology, 16th International Congress of Virology. (Article publié).
  • Lafond-Lambert C*, Bernèche-D’Amours A*, Gagnon V*, Brzezinski R, Roy S. (2014). Characterization and Gene Expression of Torulose Hyphae Morphotype in Frankia alni ACN14a. IUMS 2014 - Union internationale des sociétés de microbiologie 14th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 14th International congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology, 16th International Congress of Virology. (Article publié).
  • Pourhassan N*, Wichard T, Roy S, Bellenger J-P. (2014). Effect of high CO2 concentration on symbiosis and metal homeostasis in Alder. 3rd International conference on Earth Science & Climate change (OMICS Group Conferences). (Article publié).
  • Barrette K*, Corbeil M-M*, Callender K, Lafond-Lambert C*, Beaudin J, Bélanger P-A, Thibault S, Smirnova E, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2014). Establishment of early successionnal shrubs on acidogenic and non-acidogenic gold mine overburden. 114th Meeting of the American Society for Microbiology. (Article publié).
  • Greer CW, Callender K*, Juck D, Roy S, Khasa D, Quoreshi A, Salifu F. (2014). Exploiting the benefits of plant-microbe interactions for remediation, revegetation and land reclamation. 39th Canadian Land Reclamation Association (CLRA) meeting. (Article publié).
  • Lafond-Lambert C*, Bernèche-D’Amours A*, Brzezinski R, Roy S. (2014). Gene Expression in Frankia alni ACN14a during Differentiation into the Torulose Hyphae Morphotype. 114th Meeting of the American Society for Microbiology. (Article publié).
  • Barrette K*, Bellenger J-P, Smirnova E, Roy S. (2014). Impact of heavy metals in gold mine tailings ponds on the actinorhizal symbiosis in alder shrubs. IUMS 2014 - Union Internationale des Sociétés de Microbiologie. 14th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 14th International congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology, 16th International Congress of Virology. (Article publié).
  • Allard N*, Poulin-Laprade D*, Burrus V, Brzezinski R, Roy S. (2014). Improvement of counterselection technique following intergeneric conjugation with actinomycetes using a donor strain auxotrophic for diaminopimelic acid (DAP). IUMS 2014 - Union internationale des sociétés de microbiologie 14th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 14th International congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology, 16th International Congress of Virology. (Article publié).
  • Callender K*, Roy S, Khasa D, Whyte L, Greer C. (2014). Microbial community dynamics during the phytoremediation of gold mine residues at Val d'Or, QC using Frankia-inoculated alders. IUMS 2014 - Union internationale des sociétés de microbiologie 14th International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 14th International congress of Mycology and Eukaryotic Microbiology, 16th International Congress of Virology. (Article publié).
  • Nadeau MB, Aziez A*, Roy S, Greer CW, Khasa DP. (2014). Picea glaucaDevelopment of a new green technology for the revegetation of abandoned gold mine tailings using specific symbiotic microorganisms associated with. Proceeding 9th International Conference on Mine Closure, (Article publié).
  • Corbeil M-M*, Callender K, Lafond-Lambert C*, Barrette K*, Beaudin J, Thibault S, Khasa D, Greer CW, Roy S. (2014). Survival and Growth of Actinorhizal Shrubs on Gold Mine Fine Tailing Ponds - Assessing their Potential for Revegetation. 114th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Bissonnette C*, Garneau L*, Beaudin J, Fahlman B, Peru KM, Quoreshi A, Headley JV, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2014). Using Frankia, Mycorrhizae and Indigenous Shrubs to Revegetate Canadian Oil Sands Industry Mine Tailings. Canadian Land Reclamation Association, National Meeting. (Article publié).
  • Pourhassan N*, Wichard T, Roy S, Bellenger J-P. (2013). Effect of high CO2 concentration on symbiosis and metal homeostasis in alder. CBGRC: Chemistry and Biochemistry Graduate Research Conference. (Article publié).
  • Corbeil M-M*, Beaudin J, Jørgensen RH*, Greer CW, Roy S. (2012). Distribution of the alder endophyte Frankia sp. and phylogenetic analysis of soil microbial populations in Greenland. 112th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Bernèche-D'Amours A*, Lafond-Lambert C*, Rodrigue S, Roy S. (2012). Microscopic characterization and transcriptomic analysis of reproductive torulose hyphae morphogenesis in Frankia sp. ACN14a. 112th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Bissonnette C*, Beaudin J, Fahlman B, Peru KM, Quoreshi A, Headley JV, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2012). Reclamation of Canadian Oil Sands Industry Mine Tailings Using Frankia, Mycorrhizae and Indigenous Shrubs. 112th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Beaudin J, Allard N*, Bernèche-D'Amours A*, Ghinet MG, Brzezinski R, Roy S. (2012). Stable genetic manipulation of the nitrogen-fixing actinobacterium Frankia sp. 112th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2010). Frankia-alder symbiosis tolerance to heavy metals: a promising association for the revegetation of contaminated ecosystems. ISME 13th International Symposium on Microbial Ecology. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Mallet P-L*, Roy S. (2010). La revégétalisation d'écosystèmes perturbés au Québec et en Alberta: évaluation de la tolérance des aulnes et de leur symbiose au stress anthropogénique. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF). (Article publié).
  • Ghinet MG, Roy S, Brzezinski R, Burrus V. (2010). Molecular structure of actinomycete integrating conjugative elements (AICEs) in soil-dwelling actinobacteria of the genus Frankia. 110th General Meeting of the American Society for Microbiology. (Article publié).
  • Bissonnette C*, Mallet P-L*, Greer CW, Roy S. (2010). Tolerance of alder and its actinorhizal symbiont Frankia to Alberta oil sands residues. ISME 13th International Symposium on Microbial Ecology. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2010). Utilisation d’aulnes symbiotiques pour la revégétalisation des sites contaminés par les métaux: mission possible!. Colloque annuel du Centre SÈVE. (Article publié).
  • Bernèche-D'Amours A*, Ghinet MG, Beaudin J, Brzezinski R, Roy S. (2010). rpoB and rpoD gene fragments as new tools in assessing phylogenetic diversity of genus Frankia. ISME 13th International Symposium on Microbial Ecology. (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2009). Effect of heavy metal toxicity on Frankia sp. and its symbiosis with black alder (Alnus glutinosa (L.) Gaertn). XIV International Congress On Molecular Plant-Microbe Interactions (MPMI). (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2009). Effects of Heavy Metal Toxicity on the Survival of the Nitrogen-Fixing Bacteria Frankia sp. 109th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2009). Impact of Oil Sand Exploitation Activities in Alberta on Frankia sp.-Alder Symbiosis. 109th General Meeting of the American Society for Microbiology (ASM). (Article publié).
  • Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2009). Impact of Tailing Sand on the Establishment of the Frankia sp.-Alder Symbiosis. XIV Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions (MPMI). (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2009). Impact of heavy metals on the symbiosis of Frankia and black alder (Alnus glutinosa (L.) Gaertn). 59th Annual Conference of the Canadian Society of Microbiologists (CSM). (Article publié).
  • Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2009). Impact of salts and naphthenic acids from the oil sands industry on the metabolism of the nitrogen-fixing alder symbiont Frankia sp. 59th Annual General Meeting of the Canadian Society of Microbiologists (CSM). (Article publié).
  • Greer CW, Lefrançois E*, Quoreshi A, Khasa DP, Fung M, Whyte LG, Roy S. (2008). Alder-Frankia symbionts enhance the remediation and revegetation of oil sands tailings. Petroleum Technology Alliance Canada (PTAC) Forum. (Article publié).
  • Quoreshi A, Lefrançois E*, Fung M, Roy S, Greer CW, Khasa DP. (2008). Microbial Biotechnology Enhances the Reclamation of Disturbed Lands in the Oil Sands Industry. Canadian Land Reclamation Association National Conference. (Article publié).
  • Bernèche D'amours A*, Beaudin J, Gagnon J, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Beaulieu C, Roy S. (2008). Revégétalisation de sites perturbés par l’activité industrielle; évaluation de méthodes alternatives pour l’inoculation d’aulnes avec Frankia sp. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF). (Article publié).
  • Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2008). Un mariage plante-microorganisme afin de revégétaliser les sols perturbés de l'Alberta. Journée de la recherche (U. Sherbrooke). (Article publié).
  • Mallet P-L*, Quoreshi A, Khasa DP, Greer CW, Roy S. (2008). Étude de l’impact du stress anthropogénique retrouvé dans les sols bitumineux de l’Alberta sur le métabolisme de Frankia sp. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF). (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2008). Étude du stress anthropogénique causé par les métaux lourds chez Frankia sp. et sa symbiose avec l’aulne. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF). (Article publié).
  • Bélanger P-A*, Roy S. (2008). Étude du stress microbien chez Frankia spp. en présence de métaux lourds contaminant l'environnement. Journée de la recherche (U. Sherbrooke). (Article publié).
  • Greer CW, Lefrançois E*, Quoreshi A, Khasa DP, Fung M, Whyte LG, Roy S. (2007). Alder-Frankia symbionts enhance the remediation and revegetation of oil sands tailings. Remediation Technologies Symposium 2007. (Article publié).

Propriétés intellectuelles

Licences

  • Convention de licence de valorisation de pochettes et souches pour la plantation de végétaux. (2016). (Licence obtenue).
  • Convention de licence de valorisation des pochettes pour revégétaliser. (2015). (Licence obtenue).

Marques de commerce

  • SherPAQ. (En instance).

Autres contributions

Cours enseignés

  • Séminaires 2. PBI 702. (2015-08-25).Université de Sherbrooke. Canada.
  • Séminaires 3. PBI 706. (2015-08-25).Université de Sherbrooke. Canada.
  • Séminaires 4. PBI 708. (2015-08-25).Université de Sherbrooke. Canada.
  • Microbiologie industrielle et biotechnologie. MCB 602. (2013-08-27).Université de Sherbrooke. Canada.
  • Microbiologie industrielle et biotechnologie. MCB 510. (2007-04-30).Université de Sherbrooke. Canada.
  • Travaux pratiques de physiologie microbienne. MCB 501. (2007-04-30).Université de Sherbrooke. Canada.

Activités de collaboration internationale

  • Collaborator. Allemagne. FrankiaCollaboration with Thomas Wichard (U.Jena) to identify siderophores and other metallophores (i.e. molybdophores) produced by spp., and measure their level of specificity for essential (vs toxic) metals. Investigation of the environmental conditions that trigger the production of these metallophores. Third objective (starts October 2017): T. Wichard will send another student to Sherbrooke (in collaboration with JP Bellenger, UdeS Chemistry Department) to study how iron and Mo and N influence molybdophore and siderophore production in spp. This research does not overlap, but is synergistic, with the work I project to conduct in upcoming years, as molybdenum and iron are essential to support a healthy and well-functionning alder- symbiosis. Understanding what underlying mechanisms may play a role in acquiring these essential micronutrients could help us explain the (good) performance of alders on metal-contaminated sites.

Présentations

  • (2019). Développement d’approches durables en restauration minière au Québec: l’exploitation d’arbustes symbiotiques pour initier la végétalisation des résidus fins et des stériles. 40e Québec Mines + Énergie. Québec, Canada
  • (2015). L’Université de Sherbrooke, partenaire pour la revégétalisation minière sans préparation du site. Québec Mines 2015. Québec, Canada
  • (2015). Utilisation d'arbustes symbiotiques pour initier la revégétalisation de sites miniers en Alberta et au Québec. Americana 2015. Montréal, Canada
  • (2014). La phytotechnologie: un moteur important pour le développement durable dans l’industrie minière. 18th annual meeting of the Chapitre Saint-Laurent (SETAC chapter). Québec, Canada
  • (2014). La végétation des haldes de stériles: défis, concepts et travaux en cours. Colloque des Nouvelles approches de traitement des eaux et de biorestauration de sites industriels. Orford, Canada
  • (2013). Utilisation d'arbustes symbiotiques pour initier la revégétalisation de sites miniers en Alberta et au Québec. Colloque annuel de l'Association canadienne de réhabilitation des sites dégradés (Chapitre Québec). Bécancour, Canada
  • Fortin JA, Khasa DP, Piché Y, Roy S, Greer CW. (2012). Écoréhabiltation des sites fortement perturbés par des plantes actinomycorhiziennes : expériences québécoises?. 80e Congrès de l'Acfas. Montréal, Canada
  • (2010). Frankia: de la biologie à la biotechnologie. Colloque annuel du Centre SÈVE. Orford, Canada
  • (2008). L'actinorhize au 21e siècle: à la merci ou à la rescousse de l'activité industrielle?. Colloque annuel du Centre d'étude de la forêt (CEF). Québec, Canada
  • (2007). Étude de l'impact du stress anthropogénique sur Frankia et l'actinorhize. Colloque annuel du Centre SÈVE. Mont St-Hilaire, Canada