Le laboratoire met à la disposition des étudiantes et étudiants, professeurs et chercheurs des équipements analytiques conventionnels. Outre ces appareils, le laboratoire est muni d'un ensemble d'équipements pour faciliter l'échantillonnage, le positionnement des relevés et l'analyse sur le terrain.

• Fluorimètre de laboratoire pour la mesure de la physiologie (PSI Dual-Modulation Kinetic Fluorometer FL-3500)
• Fluorimètre TURNER (Turner Designs) avec module pour chlorophylle sans acidification et module pour la phycocyanine
• Système automatisé de culture de microalgues en continu
• Coulter Counter (Beckman coulter)
• Spectophotomètre (Secomam Uvi light PC2 )
• Microscope inversé à épifluorescence Zeiss (Axio Observer D1) avec Contraste de phase et DIC muni d’une caméra Zeiss Axiocam couleur
• Compteur à scintillation liquide (Tri-Carb 2910 TR de PERKIN ELMER)
• Chambre de culture d’algues (Thermo Scientific modèle 808)
• Autoclave (Tuttnauer) modèle 3850
• Enceinte de sécurité biologique (classe II type A2) Thermo Scientific
• Spectrophotomètre d'absorption atomique (PERKIN ELMER 1100B)
• 2 Rampes de filtration
• Boîte à gants
• Fours à moufle et à air forcé
• Balances de précision, pHmètres, conductimètres
• Tamiseuses à vibration

• Sondes multi paramètre (YSI modèle 600R)
• Oxymètre Hach HQ30d avec sonde LDO
• Laboratoire portatif pour analyses d'eau (Hach DREL 2000)
• Plusieurs GPS GARMIN 76
• Un Démodulateur garde-côtière (GBR 21)
• Un système DGPS SXBLUE muni d'un récepteur GPS de précision 12 canaux «Wass »
• Différents types d'échantillonneurs et de carottiers