Coordonnées

Courriel : Isabelle.Laforest-Lapointe@USherbrooke.ca
Téléphone : 819 821-8000, poste 63473
Local : D8-1016

Formation

B. Sc. Biologie, Université Laval (2010)

M. Sc. Écologie Terrestre et Gestion de la Biodiversité, Universitat Autònoma de Barcelona (UAB) (2011)

Maîtrise professionnelle en statistiques, Universitat Politècnica de Catalunya (UPC) (2012)

Ph. D. Biologie, Université du Québec à Montréal (UQAM) (2017)

Postdoctorat sur le microbiome humaine, University of Calgary (2019)

Thèmes de recherche

  • Microbiote
  • Écologie microbienne
  • Écologie des communautés
  • Microbiologie
  • Génomique
  • Bio-informatique
  • Statistiques
  • Interactions hôte-microorganismes
  • Écologie végétale
  • Biodiversité - fonctions des écosystèmes 

Recherches actuelles

Mon programme de recherche s’intéresse aux interactions hôtes-microbes (principalement chez les plantes et les êtres humains) vues à travers la génomique et la microbiologie. Au cours des dernières années, j’ai développé une expertise de recherche novatrice basée sur l’application de la bio-informatique et de l’écologie à l’utilisation des méthodes de séquençage génétique de nouvelle génération (génomique, métagénomique, métabolomique, etc.). Ma recherche porte sur les dynamiques temporelles et spatiales des interactions arbres-microbes en milieu naturel (Laforest- Lapointe et al. 2016, Microbiome), ainsi que sur la variabilité intra- et interindividuelle du microbiome foliaire des arbres (Laforest-Lapointe et al. 2016, PeerJ) et des traits fonctionnels (Laforest-Lapointe et al. 2014, Oecologia).

J’ai examiné notamment la structure taxonomique, phylogénique et fonctionnelle des communautés bactériennes des arbres afin d’améliorer notre compréhension de leur influence sur le succès reproductif des plantes-hôtes et sur la productivité des communautés végétales (Laforest-Lapointe et al. 2017, Nature). J’ai également étudié la biodiversité urbaine, plus précisément l’écologie microbienne des environnements urbains et semi-urbains (Laforest-Lapointe et al. 2017, mSystems).

Durant mon post doctorat, j’ai acquis une nouvelle expertise en microbiologie, en immunologie et dans le domaine du microbiome humain. Mes travaux ont porté sur les interactions inter-domaines au sein du microbiome de l’intestin et sur leur influence sur le développement du système immunitaire dans les
trois premières années de vie (Laforest-Lapointe & Arrieta 2017, Frontiers in Immunology; Laforest- Lapointe & Arrieta 2018, mSystems; Nieves-Ramírez et al. 2018, mSystems). Cette expertise sur le microbiome humain et en immunologie consolide l’aspect multidisciplinaire de ma recherche à l’intersection entre la génomique, la microbiologie, l’écologie et les interactions hôte-microbes (microbiome).

Ma philosophie d’enseignement est basée sur l’éducation coopérative et l’apprentissage par expérience. Je crois fermement à l’importance de l’implication de l’étudiant par apprentissage actif et à l’accès universel à la science. Je suis une passionnée de la communication et de l’enseignement. 

Publications

Laforest-Lapointe, I. & Whitaker, B. (2019) Decrypting the Phyllosphere Microbiome: Progress and Challenges. American Journal of Botany 106(2):171-173. 10.1002/ajb2.1229

*Wallace, J., *Laforest-Lapointe, I. & Kembel, SW. (2018) Variation in the Leaf and Root Microbiome of Sugar Maple (Acer saccharum) at an Elevational Range Limit. PeerJ, 6:e5293. 10.7717/peerj.5293

Laforest-Lapointe, I. & M.C. Arrieta. (2018) Microbial Eukaryotes: A Missing Link in Gut Microbiome Studies. mSystems, 3:e00201-17. 10.1128/mSystems.00201-17

Laforest-Lapointe, I., Messier, C. & Kembel, SW. (2017) Tree Leaf Bacterial Community Structure and Diversity Differ along a Gradient of Urban Intensity. mSystems, 2(6):e00087-17. 10.1128/mSystems.00087-17

Laforest-Lapointe, I. & M.C. Arrieta. (2017) Patterns of Early-Life Gut Microbial Colonization during Human Immune Development: An Ecological Perspective. Frontiers in Immunology, 8(788), 1664-3224. 10.3389/fimmu.2017.00788

Laforest-Lapointe, I., Paquette, A., Messier, C. & Kembel, SW. (2017) Leaf Bacterial Diversity Mediates Plant Diversity – Ecosystem Function Relationships. Nature, 546(7656): 145-147. 10.1038/nature22399

Laforest-Lapointe, I., Messier, C. & Kembel, SW. (2016) Tree Phyllosphere Bacterial Communities: Exploring the Magnitude of Intra- and Inter-Individual Variation Among Host Species. PeerJ, 4:e2367. 10.7717/peerj.2367

Laforest-Lapointe, I., Messier, C. & Kembel, SW. (2016) Host Species Identity, Site and Time Drive Temperate Tree Phyllosphere Bacterial Community Structure. Microbiome, 4(1):1. 10.1186/s40168-016-0174-1

Laforest-Lapointe, I., Martínez-Vilalta, J. & Retana, J. (2014) Intraspecific Variation in Functional Traits Matters: Case Study of Scots Pine. Oecologia. 175(4):1337-1348. 10.1007/s00442-014-2967-x