BCH723 - Sujets d'actualité en génomique

programmes offrant cette activité pédagogique (cours)

Maîtrise en biochimie

Sommaire

Cycle
2e cycle
Crédits
2 crédits
Durée
1 trimestre
Faculté/Centre
Faculté de médecine et des sciences de la santé
Répartition de la charge de travail
2-0-4
Cible(s) de formation

Comprendre la démarche scientifique, les méthodologies expérimentales et les outils bio-informatiques utilisés en génomique.

Contenu

Introduction au séquençage à haut débit; alignement de séquences; principales applications du séquençage et bref flot d’analyse de données : ChIP-Seq, Exome-Seq, séquençage de génomes entiers, RNA-Seq, analyse d’expression différentielle (Cufflink, DESeq), analyse d’épissage (TopHat, MISO), RIP-seq et variants, assemblage de novo; conception expérimentale, statistiques et exemples d’expériences de séquençage à haut débit; présentation d'une analyse approfondie d’expression différentielle par séquençage à haut débit.